63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1543 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1543  Hpt domain-containing protein  100 
 
 		 115 aa  233  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.964594  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1965  Hpt domain protein  52.25 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.097827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3687  Hpt protein  52.34 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.556263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3923  Hpt protein  50.45 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4362  Hpt protein  52.34 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20800  histidine phosphotransfer domain-containing protein  50.88 
 
 		 116 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2818  Hpt protein  50.88 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0345931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1785  hypothetical protein  50.88 
 
 		 116 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1505  Hpt protein  52.34 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181753  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3450  hypothetical protein  46.85 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34350  histidine-containing phosphotransfer protein  51.82 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.223554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1990  Hpt protein  45 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 705 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 1240 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 818 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2193  Hpt protein  37.5 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  38.1 
 
 		 968 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.73 
 
 		 1499 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 818 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 977 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 801 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3860  Hpt protein  31.3 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0985  Hpt domain-containing protein  33.05 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1213  Hpt domain-containing protein  29.47 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.765008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 1820 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0165  Hpt domain-containing protein  37.97 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 738 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 		 1069 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 1014 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 1369 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 1692 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2178  hypothetical protein  31.33 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1723  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  35.37 
 
 		 285 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 		 781 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 1118 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1632 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 932 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1498 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 1132 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  29.17 
 
 		 793 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 1433 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.3 
 
 		 1258 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  28.85 
 
 		 1001 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 1397 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  32.65 
 
 		 1322 aa  42.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.27 
 
 		 876 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2648  Hpt protein  30.12 
 
 		 116 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 		 1202 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6148  histidine phosphotransfer domain-containing protein  32.53 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00449126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1441  Hpt protein  28.16 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 929 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 950 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 925 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 850 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 920 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1020 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.58 
 
 		 1120 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 965 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 899 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.618287  normal  0.57938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  32.91 
 
 		 1574 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 880 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1152  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1025 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1020 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>