13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2648 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2648  Hpt protein  100 
 
 		 116 aa  233  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6148  histidine phosphotransfer domain-containing protein  71.84 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00449126  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2871  Hpt protein  74.68 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2886  Hpt protein  47.57 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0496  Hpt protein  48.91 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3484  Hpt domain protein  41.12 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0070  Hpt domain-containing protein  36.62 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 		 1020 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 		 1030 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1543  Hpt domain-containing protein  30.12 
 
 		 115 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.964594  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1152  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 		 1025 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3923  Hpt protein  34.67 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 		 1020 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>