More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2455 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
263 aa  548  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  67.44 
 
 
257 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  42.52 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  40.4 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3842  protein serine/threonine phosphatase  36.18 
 
 
262 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104123  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1469  protein serine/threonine phosphatase  36.59 
 
 
249 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  36.65 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4063  protein serine/threonine phosphatase  32.68 
 
 
255 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000181266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  29.32 
 
 
300 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  32.66 
 
 
306 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
307 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.51 
 
 
299 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 
301 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  30.24 
 
 
300 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.1 
 
 
299 aa  99.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.24 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  28.74 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  28.92 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  32.88 
 
 
421 aa  96.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  27.67 
 
 
304 aa  95.9  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  32.76 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  28.34 
 
 
306 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  29.13 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  30.61 
 
 
304 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  31.85 
 
 
320 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  30.2 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  28.85 
 
 
304 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  28.74 
 
 
304 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  30.43 
 
 
302 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.19 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  28.92 
 
 
241 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  33.02 
 
 
538 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  33.98 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  30.43 
 
 
463 aa  89.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  31.68 
 
 
267 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.92 
 
 
611 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  32.4 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  32.39 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  31.6 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  31.08 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.38 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  28.26 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  27.56 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  33.18 
 
 
248 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  33.05 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  31.36 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  27.88 
 
 
323 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  32.39 
 
 
595 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  30.64 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  34.67 
 
 
500 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  27.43 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  33.04 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  34.52 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  28.19 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.18 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  31.96 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  27.34 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  29.33 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.17 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  28.21 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  31.58 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  32.02 
 
 
564 aa  82.8  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  31.28 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  30.8 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  30.66 
 
 
449 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  29.68 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.88 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  29.58 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.58 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.87 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  29.96 
 
 
242 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  31.58 
 
 
554 aa  82  0.000000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  32.04 
 
 
467 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  31.87 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  29.31 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  28.85 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  31.14 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  31.14 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  28.23 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  29.24 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  27.19 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  30.84 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  28.06 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2322  Phosphoprotein phosphatase  30.05 
 
 
455 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  31.66 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.1 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  30.22 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  28.51 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  31.86 
 
 
519 aa  80.1  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.73 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  33.49 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  32.74 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1283  protein serine/threonine phosphatase  31.92 
 
 
482 aa  79.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.646496  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  30.43 
 
 
462 aa  79.7  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  26.79 
 
 
417 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  32.45 
 
 
597 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  30.28 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  28.74 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  27.52 
 
 
425 aa  79.3  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>