More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4326 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  70.16 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  65.25 
 
 		 299 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  63.28 
 
 		 300 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  63.28 
 
 		 300 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  63.23 
 
 		 305 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  63.96 
 
 		 304 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  62.01 
 
 		 299 aa  381  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  57.98 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  58.12 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  57.43 
 
 		 301 aa  359  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  48.69 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  46.73 
 
 		 304 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  45.42 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  45.1 
 
 		 304 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  44.92 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  41.5 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  39.55 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  41.42 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  40.26 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  31.98 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  35.96 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  36.02 
 
 		 564 aa  109  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 		 269 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  38.08 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  30.04 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  31.82 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  36.11 
 
 		 554 aa  104  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.12 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  32.75 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  35.96 
 
 		 466 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  36.24 
 
 		 425 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  30.58 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  28.06 
 
 		 250 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  28.85 
 
 		 250 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  34.57 
 
 		 477 aa  99.8  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  29.25 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  29.25 
 
 		 250 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  31.02 
 
 		 252 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  34.6 
 
 		 463 aa  99.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  32.47 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  33.05 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  28.85 
 
 		 250 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  28.85 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  28.85 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  28.85 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  31.33 
 
 		 538 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  32.6 
 
 		 236 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  32.08 
 
 		 256 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  28.85 
 
 		 250 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  28.85 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  31.3 
 
 		 236 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  31.47 
 
 		 238 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  30.68 
 
 		 259 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  33.62 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  34.02 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  33.77 
 
 		 463 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  30.68 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  31.17 
 
 		 240 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  29.77 
 
 		 245 aa  95.9  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  32.11 
 
 		 445 aa  95.9  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  28.12 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.85 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  34.48 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  30.93 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  33.81 
 
 		 395 aa  94  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  34.2 
 
 		 449 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  32.46 
 
 		 597 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  32.91 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  30.2 
 
 		 258 aa  93.6  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  30.61 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  32.2 
 
 		 505 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  30.52 
 
 		 633 aa  93.2  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  30.17 
 
 		 244 aa  93.2  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  33.91 
 
 		 469 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  26.94 
 
 		 249 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  30.57 
 
 		 271 aa  92.8  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 		 438 aa  92.8  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  36.4 
 
 		 474 aa  92.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  31.15 
 
 		 254 aa  92.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  33.64 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 		 256 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  33.8 
 
 		 507 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  32.64 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  37.72 
 
 		 234 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  30 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  34.96 
 
 		 467 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  29.49 
 
 		 243 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  32.11 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  32.64 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.54 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  32.4 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  31.71 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  31.95 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.95 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  31.52 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  32.49 
 
 		 421 aa  90.1  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>