More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0207 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 269 aa  547  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  43.43 
 
 		 257 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  42.52 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  43.92 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1469  protein serine/threonine phosphatase  41.03 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3842  protein serine/threonine phosphatase  36.44 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104123  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4063  protein serine/threonine phosphatase  36.18 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000181266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  35.1 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 		 300 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.58 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.8 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  35.77 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  32.94 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  34.77 
 
 		 304 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.35 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  33.58 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  32.26 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  31.87 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  32.79 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  32 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  35.41 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  31.6 
 
 		 306 aa  99.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  32.48 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  33.62 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  35.04 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  34.98 
 
 		 538 aa  97.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  33.91 
 
 		 240 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  34 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  34 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  31.03 
 
 		 241 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  32.77 
 
 		 415 aa  93.2  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  31.47 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1212  protein serine/threonine phosphatase  29.08 
 
 		 770 aa  92.4  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  33.33 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  32.35 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  32.91 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  33.06 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  30.74 
 
 		 445 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  35.08 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  31.08 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  34.78 
 
 		 574 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  34.74 
 
 		 416 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 		 259 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  31.11 
 
 		 421 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.09 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  29.62 
 
 		 313 aa  85.9  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  32.71 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  28.24 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  29.13 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  30.24 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  32.07 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  32.24 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  31.94 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3377  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.08 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.427696  decreased coverage  0.000190806 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  34.88 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  32.88 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  31.4 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.38 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2970  protein serine/threonine phosphatase  30.22 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.489597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  32.84 
 
 		 463 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  30.84 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  30.65 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.96 
 
 		 470 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  35.81 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  27.6 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  26.09 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  31.65 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  30.67 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  30.88 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  31.28 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  34.54 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  32.2 
 
 		 633 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  31.34 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  28.97 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.03 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  27.31 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.19 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  31.53 
 
 		 565 aa  79  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  26.46 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  28.62 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  28.45 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2322  Phosphoprotein phosphatase  32.84 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  30.68 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1226  putative protein serine/threonine phosphatase  27.99 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  28.64 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0002  protein serine/threonine phosphatase  29.19 
 
 		 617 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.818409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  31.74 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  29.57 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  29.72 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  31.33 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  29 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0590  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.55 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.53 
 
 		 419 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>