More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3377 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3377  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
269 aa  556  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.427696  decreased coverage  0.000190806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  36.4 
 
 
395 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  34.87 
 
 
236 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  37.08 
 
 
452 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  34.73 
 
 
425 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.12 
 
 
237 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  35.47 
 
 
394 aa  125  9e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  33.04 
 
 
236 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.71 
 
 
238 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  32.37 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  31 
 
 
505 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  32.6 
 
 
472 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  36.48 
 
 
467 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  32.39 
 
 
426 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  35.94 
 
 
320 aa  116  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  32.54 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  32.37 
 
 
264 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  30.65 
 
 
239 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  35.47 
 
 
236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  32.93 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  30.31 
 
 
245 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  31.91 
 
 
463 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  32.92 
 
 
243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  32.31 
 
 
416 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.19 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  31.8 
 
 
519 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.39 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  29.96 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3671  putative serine/threonine phosphatase  31.93 
 
 
246 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  31.76 
 
 
386 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  32.14 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  32.14 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  35 
 
 
469 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  37.44 
 
 
305 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  32.11 
 
 
477 aa  112  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  31.1 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  31.93 
 
 
540 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  30.13 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  32.79 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  31.46 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  29.91 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  31.13 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  33.18 
 
 
466 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  33.47 
 
 
463 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  31.82 
 
 
449 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  35.51 
 
 
319 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  31.97 
 
 
474 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  28.29 
 
 
254 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  31.88 
 
 
478 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  29.27 
 
 
246 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  30.95 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1366  protein serine/threonine phosphatase  31.05 
 
 
280 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  31.89 
 
 
441 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  33.91 
 
 
267 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  32.77 
 
 
262 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  32.65 
 
 
240 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  34.13 
 
 
261 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  28.34 
 
 
241 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  30.47 
 
 
259 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  30.47 
 
 
259 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.44 
 
 
482 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  27.8 
 
 
241 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  36.89 
 
 
348 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  30.34 
 
 
443 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  33.03 
 
 
269 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  31.38 
 
 
241 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  29.18 
 
 
280 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  33.78 
 
 
255 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  29.86 
 
 
257 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  34.47 
 
 
234 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  34.85 
 
 
239 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  29.15 
 
 
250 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  30.83 
 
 
253 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
276 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6845  cyclic nucleotide-binding protein  31 
 
 
396 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  30.45 
 
 
261 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  31.84 
 
 
241 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  35.02 
 
 
234 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0530  serine/threonine protein phosphatase, putative  27.92 
 
 
249 aa  103  4e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.467374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  29.29 
 
 
250 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4570  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 
295 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0814124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  31.33 
 
 
241 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  29.25 
 
 
245 aa  102  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  32.22 
 
 
421 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  31.91 
 
 
268 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  28.05 
 
 
250 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  29.29 
 
 
250 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.21 
 
 
419 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  29.92 
 
 
247 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  29.92 
 
 
247 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  34.95 
 
 
462 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.3 
 
 
241 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  33.18 
 
 
491 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  32.5 
 
 
500 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  31.4 
 
 
242 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  29.1 
 
 
258 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 
404 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.18 
 
 
491 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1295  protein serine/threonine phosphatase  30.86 
 
 
240 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>