More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2087 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  100 
 
 
445 aa  910    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  42.74 
 
 
449 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  38.22 
 
 
254 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.44 
 
 
247 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  41.06 
 
 
319 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  35.91 
 
 
257 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.06 
 
 
237 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.46 
 
 
470 aa  154  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  36.26 
 
 
256 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  35.77 
 
 
236 aa  149  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  37.5 
 
 
245 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  35.74 
 
 
321 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  43.13 
 
 
292 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  36.05 
 
 
258 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  37.1 
 
 
538 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  37.01 
 
 
238 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  39 
 
 
415 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  32.81 
 
 
270 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  36.99 
 
 
236 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  35.88 
 
 
256 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  36.97 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 
253 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  37.31 
 
 
276 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  36.72 
 
 
267 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  34.82 
 
 
241 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  34.88 
 
 
266 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  34.38 
 
 
261 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
271 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
320 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  35.98 
 
 
478 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  35.5 
 
 
256 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  36.73 
 
 
469 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  35.5 
 
 
256 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.2 
 
 
271 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  34.51 
 
 
261 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  36.48 
 
 
250 aa  137  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  34.12 
 
 
441 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  38.11 
 
 
416 aa  136  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  35.48 
 
 
252 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  33.33 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  36.63 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  32.66 
 
 
245 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 
472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  36.69 
 
 
236 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  36.82 
 
 
395 aa  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.41 
 
 
238 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  35.74 
 
 
241 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  32.38 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  35.71 
 
 
265 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  37.2 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  34.8 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  35.74 
 
 
567 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  32.65 
 
 
236 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  35.74 
 
 
417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  30.84 
 
 
554 aa  131  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  34.26 
 
 
269 aa  130  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  34.98 
 
 
394 aa  129  8.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  36.76 
 
 
268 aa  129  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  34.94 
 
 
313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  35.63 
 
 
571 aa  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  34.77 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  34.21 
 
 
280 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.96 
 
 
261 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0318  serine/threonine phosphatase, putative  36.69 
 
 
245 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  34.07 
 
 
435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  35.54 
 
 
249 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  32.93 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  33.07 
 
 
540 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  33.99 
 
 
252 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1366  protein serine/threonine phosphatase  35.66 
 
 
280 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  33.2 
 
 
564 aa  126  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  34.41 
 
 
296 aa  126  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  33.74 
 
 
247 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  34.41 
 
 
558 aa  126  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3435  protein serine/threonine phosphatases  34.85 
 
 
281 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 
239 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
449 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  36.51 
 
 
519 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  33.61 
 
 
421 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  33.47 
 
 
474 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  34.25 
 
 
463 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
280 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 
271 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.96 
 
 
611 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
280 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  33.61 
 
 
519 aa  123  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  39.69 
 
 
264 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  33.89 
 
 
247 aa  123  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  33.89 
 
 
247 aa  123  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2163  protein serine/threonine phosphatase  36.69 
 
 
337 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.27 
 
 
482 aa  123  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  34.32 
 
 
514 aa  123  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  33.96 
 
 
255 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.88 
 
 
243 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  34.27 
 
 
241 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  33.06 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  34.26 
 
 
507 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>