More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3842 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3842  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104123  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1469  protein serine/threonine phosphatase  63.41 
 
 
249 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  36.18 
 
 
263 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  36.44 
 
 
269 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  38.15 
 
 
257 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  38.15 
 
 
279 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  38.37 
 
 
256 aa  131  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4063  protein serine/threonine phosphatase  34.54 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000181266 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  32.13 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  26.72 
 
 
241 aa  112  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  31.73 
 
 
247 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  31.4 
 
 
305 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1212  protein serine/threonine phosphatase  27.97 
 
 
770 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  33.21 
 
 
276 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.32 
 
 
252 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  33.06 
 
 
306 aa  105  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  32.11 
 
 
306 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  35.74 
 
 
319 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  31.73 
 
 
267 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  30.28 
 
 
253 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.73 
 
 
267 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  26.82 
 
 
273 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  33.18 
 
 
259 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  32.7 
 
 
538 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  36.48 
 
 
348 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  32.4 
 
 
300 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  31.94 
 
 
419 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  31.67 
 
 
236 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.6 
 
 
299 aa  102  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.29 
 
 
242 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  30.94 
 
 
633 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  34.63 
 
 
320 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.59 
 
 
276 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  32.11 
 
 
306 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.22 
 
 
237 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0873  protein serine/threonine phosphatase  30.92 
 
 
282 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  31.52 
 
 
389 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  30.83 
 
 
238 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  35.39 
 
 
242 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  32.52 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  34.18 
 
 
300 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.18 
 
 
300 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  30.83 
 
 
255 aa  99  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  31.85 
 
 
258 aa  99.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  33.87 
 
 
304 aa  99.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  31.47 
 
 
253 aa  99  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  32.26 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  32 
 
 
304 aa  98.6  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  28.21 
 
 
250 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  32.57 
 
 
307 aa  98.6  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  31.95 
 
 
236 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  31.06 
 
 
574 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  35.05 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  34.98 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  28.21 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  28.21 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  28.21 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  28.21 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  28.21 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  28.21 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  30.19 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  35.02 
 
 
304 aa  95.9  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  30.92 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  27.71 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  30.49 
 
 
304 aa  95.5  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  30.8 
 
 
252 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  33.6 
 
 
256 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0318  serine/threonine phosphatase, putative  29.36 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  28.69 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  30.08 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.27 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  30.96 
 
 
305 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
422 aa  94  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  30.12 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  29.32 
 
 
255 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  30.08 
 
 
304 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  28.91 
 
 
395 aa  93.6  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.06 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  30.81 
 
 
425 aa  93.2  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  32.13 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0002  protein serine/threonine phosphatase  30.36 
 
 
617 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.818409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  28.39 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  27.73 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  35.92 
 
 
276 aa  92  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  34.06 
 
 
256 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  29.61 
 
 
250 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.78 
 
 
247 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  29.95 
 
 
250 aa  92.4  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  34.06 
 
 
256 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  31.09 
 
 
270 aa  92  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0590  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.85 
 
 
241 aa  92  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  26.05 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  32.64 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  29.41 
 
 
304 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  32.42 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  34.06 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  30.94 
 
 
548 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  32.05 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  31.66 
 
 
301 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  33.17 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>