More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2176 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 255 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  68.24 
 
 		 267 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  68.24 
 
 		 267 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  65.08 
 
 		 252 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  64.96 
 
 		 253 aa  364  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  66.54 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  63.49 
 
 		 253 aa  357  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  62.7 
 
 		 256 aa  346  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  61.35 
 
 		 276 aa  339  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  61.85 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2879  protein serine/threonine phosphatase  54.62 
 
 		 255 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395798 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  44.49 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  42.51 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  34.6 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  33.18 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  31.33 
 
 		 304 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  32.13 
 
 		 304 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  31.73 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.51 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  31.82 
 
 		 597 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  32.5 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  32.93 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  33.47 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  31.15 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  31.58 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  31.73 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.15 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.8 
 
 		 611 aa  101  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  33.91 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  33.93 
 
 		 466 aa  99.8  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.02 
 
 		 438 aa  99  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  31.3 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  30.83 
 
 		 306 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  32.54 
 
 		 422 aa  97.1  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.31 
 
 		 299 aa  96.3  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  35.47 
 
 		 421 aa  95.9  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  32.14 
 
 		 571 aa  95.1  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  30.2 
 
 		 323 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  32.02 
 
 		 548 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  31.6 
 
 		 567 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  32.29 
 
 		 558 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  30.47 
 
 		 325 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 404 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  30.36 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  35.48 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  38.13 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  38.32 
 
 		 426 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  29.24 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  29.1 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 		 463 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  29.55 
 
 		 313 aa  92.4  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  34.39 
 
 		 274 aa  92  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 		 449 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  30.56 
 
 		 306 aa  92.4  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.85 
 
 		 519 aa  92  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  32.11 
 
 		 304 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  33.49 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  32.66 
 
 		 472 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  31.05 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  30.51 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  31.05 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  32.76 
 
 		 519 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  29.79 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  34.68 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  34.51 
 
 		 389 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  29.27 
 
 		 386 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  34.55 
 
 		 474 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  32.02 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.68 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  30.47 
 
 		 394 aa  90.1  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  35.23 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  33.8 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  30.99 
 
 		 505 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  30.47 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  28.51 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  26.05 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  32.53 
 
 		 252 aa  88.6  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  32.27 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  32.26 
 
 		 469 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  34.11 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  32.38 
 
 		 305 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  32 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 416 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.04 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  30.05 
 
 		 477 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  30.8 
 
 		 443 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.36 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  32.32 
 
 		 479 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  30.59 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.29 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  31.33 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  34.27 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  31.28 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.78 
 
 		 242 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  32.42 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>