More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3498 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
256 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  70.52 
 
 
267 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  70.52 
 
 
267 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  68.53 
 
 
267 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  65.74 
 
 
253 aa  367  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  66.53 
 
 
253 aa  363  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  64.29 
 
 
252 aa  363  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  65.6 
 
 
276 aa  357  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  62.7 
 
 
255 aa  346  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  59.04 
 
 
255 aa  322  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2879  protein serine/threonine phosphatase  57.83 
 
 
255 aa  314  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  42.4 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  43.44 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  36.44 
 
 
264 aa  145  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  32.52 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 
302 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  32.49 
 
 
307 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  32.11 
 
 
306 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  29.39 
 
 
304 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  27.85 
 
 
306 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  29.63 
 
 
304 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  29.63 
 
 
304 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  30 
 
 
304 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  28.69 
 
 
304 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.08 
 
 
299 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.15 
 
 
300 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  33.8 
 
 
505 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  27.73 
 
 
300 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  32.66 
 
 
304 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  29.58 
 
 
301 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  34.8 
 
 
466 aa  99.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  32.57 
 
 
477 aa  99  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  32.43 
 
 
474 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  35.27 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  27.35 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  30.83 
 
 
306 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  29.77 
 
 
597 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  31.88 
 
 
519 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  32.85 
 
 
478 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.35 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  30 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  31.6 
 
 
567 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  29.31 
 
 
394 aa  94  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.3 
 
 
438 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  35.34 
 
 
463 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  28.87 
 
 
304 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  33.01 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  39.31 
 
 
279 aa  92.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.73 
 
 
239 aa  92.4  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  31.34 
 
 
558 aa  92  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.23 
 
 
299 aa  92  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  29.96 
 
 
305 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.91 
 
 
611 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  32.26 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  32.05 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  27.73 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  30.28 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  32.61 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  29.77 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  30.99 
 
 
472 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  28.51 
 
 
425 aa  89.7  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  31.8 
 
 
242 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  28.92 
 
 
274 aa  89  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  27.68 
 
 
548 aa  89  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  34.15 
 
 
462 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  28.33 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  32.13 
 
 
389 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.01 
 
 
516 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  32.02 
 
 
421 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.01 
 
 
517 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  31.36 
 
 
242 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  31.86 
 
 
571 aa  86.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  28.87 
 
 
304 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  32.06 
 
 
491 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
247 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  33.97 
 
 
514 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.06 
 
 
491 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.06 
 
 
491 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  32.89 
 
 
474 aa  85.5  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  27.35 
 
 
574 aa  85.5  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  31.08 
 
 
386 aa  85.5  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.51 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4063  protein serine/threonine phosphatase  35.33 
 
 
255 aa  85.1  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000181266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  28.4 
 
 
325 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  33.03 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 
479 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  27.34 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  32.13 
 
 
449 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  32.41 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  28.27 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.25 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  29.22 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  29.91 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.41 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  32.22 
 
 
540 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  29.95 
 
 
469 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.13 
 
 
482 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  28.63 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  29.22 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>