More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0476 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 302 aa  625  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  50.66 
 
 		 306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  50.33 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  44.19 
 
 		 304 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  43.38 
 
 		 304 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  40.73 
 
 		 304 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  40.07 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  39.74 
 
 		 304 aa  246  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  43.75 
 
 		 306 aa  244  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  40.71 
 
 		 306 aa  235  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  40.79 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  40.98 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.79 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.46 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  39.41 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  39.94 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  39.41 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  36.63 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.59 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  39 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.3 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  34.63 
 
 		 538 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  36.21 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  34.84 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  35.86 
 
 		 265 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  37.07 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.07 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  35.12 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  35.12 
 
 		 253 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  35.92 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 		 256 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.76 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.09 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  34.8 
 
 		 236 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  38.03 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  34.48 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  34.68 
 
 		 389 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  30.16 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  35.24 
 
 		 236 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  30.56 
 
 		 250 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2879  protein serine/threonine phosphatase  32.76 
 
 		 255 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395798 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  33.62 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  31.05 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  34.76 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  34.65 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  29.76 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  29.92 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  29.92 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.08 
 
 		 247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  29.92 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  29.48 
 
 		 249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  31.78 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  31.82 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  33.61 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  30.67 
 
 		 445 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  29.51 
 
 		 250 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  29.51 
 
 		 250 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  29.51 
 
 		 250 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  29.51 
 
 		 250 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  29.51 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  30.12 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  29.75 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  32.79 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  33.33 
 
 		 246 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 241 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  34.09 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  34.69 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  34.48 
 
 		 441 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.19 
 
 		 507 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  35.56 
 
 		 467 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  33.58 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  35.71 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  31.88 
 
 		 633 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  35.68 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.92 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  34.76 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  33.77 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  34.19 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  32.6 
 
 		 466 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  33.95 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  31.17 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  33.05 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.74 
 
 		 238 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  35.32 
 
 		 247 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  31.73 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  30.74 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  29.15 
 
 		 245 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  35.78 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  34.18 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  35.19 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  34.47 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  32.64 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  34.35 
 
 		 540 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 		 244 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  30.84 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>