More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3007 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
257 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  67.44 
 
 
263 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  43.43 
 
 
269 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  43.09 
 
 
256 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3842  protein serine/threonine phosphatase  38.15 
 
 
262 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104123  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1469  protein serine/threonine phosphatase  35.56 
 
 
249 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  35.8 
 
 
279 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4063  protein serine/threonine phosphatase  33.99 
 
 
255 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000181266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.47 
 
 
299 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  32.92 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  36.33 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.47 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  31.98 
 
 
304 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  32.56 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  30.04 
 
 
300 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.04 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  32.1 
 
 
306 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  31.4 
 
 
305 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  32.38 
 
 
304 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
538 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  31.82 
 
 
306 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  31.43 
 
 
304 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 
319 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  31.47 
 
 
302 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  30.86 
 
 
304 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  30.86 
 
 
304 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 
320 aa  99.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  32.16 
 
 
276 aa  98.6  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  31.25 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  35.12 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.01 
 
 
419 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  31.38 
 
 
422 aa  94.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  30.04 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  29.18 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  29.18 
 
 
256 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  32.24 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  29.18 
 
 
256 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  29.96 
 
 
255 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  28.21 
 
 
445 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  32.11 
 
 
305 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  32.4 
 
 
270 aa  92.4  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  30.45 
 
 
304 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  28.68 
 
 
255 aa  92  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  31.71 
 
 
306 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  30.23 
 
 
565 aa  91.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  28.4 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  31.6 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  31.65 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  30.08 
 
 
463 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  29.82 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.49 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  30.89 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  30.05 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  31.28 
 
 
267 aa  89  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  33.16 
 
 
276 aa  88.6  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  31.17 
 
 
574 aa  88.6  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.28 
 
 
267 aa  89  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  29.5 
 
 
417 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  28.69 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.43 
 
 
252 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.3 
 
 
276 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  29.44 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  34.55 
 
 
415 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  31.35 
 
 
416 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  30.71 
 
 
264 aa  87  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  28.17 
 
 
325 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  29.88 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  29.27 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  26.17 
 
 
323 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6845  cyclic nucleotide-binding protein  25.75 
 
 
396 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  30.08 
 
 
595 aa  85.9  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1212  protein serine/threonine phosphatase  26.75 
 
 
770 aa  85.1  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  27.51 
 
 
443 aa  85.5  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.73 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  32.43 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  26.71 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  29.39 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  29.02 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  28.88 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  31.11 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  29.03 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  30.47 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  28.74 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  32.46 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  31.42 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  25.98 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  28.21 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  29.92 
 
 
633 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.33 
 
 
242 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 
435 aa  82  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  28.38 
 
 
256 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1226  putative protein serine/threonine phosphatase  31.25 
 
 
624 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  27.35 
 
 
564 aa  81.3  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.47 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.39 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2322  Phosphoprotein phosphatase  33.14 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  29.86 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.84 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>