More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0223 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  100 
 
 		 476 aa  956    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  62.66 
 
 		 476 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  53.62 
 
 		 480 aa  488  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  51.11 
 
 		 482 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 		 477 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  50.53 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  50.11 
 
 		 477 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  50.32 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  50.53 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  49.68 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  49.47 
 
 		 477 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  49.16 
 
 		 477 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 		 476 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  48.94 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  47.46 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  47.78 
 
 		 476 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.63 
 
 		 476 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  48 
 
 		 477 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  47.67 
 
 		 475 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  47.55 
 
 		 505 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  48 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  46.3 
 
 		 476 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  45.15 
 
 		 482 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.89 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  45.47 
 
 		 475 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  45.36 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  45.36 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  45.36 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  45.99 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  46.11 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  45.36 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  45.36 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  48.24 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  48.24 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  45.57 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  45.15 
 
 		 481 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.46 
 
 		 478 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  46.71 
 
 		 487 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  48.26 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  45.15 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.83 
 
 		 478 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  47.44 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  45.53 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  44.84 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.56 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.14 
 
 		 476 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.79 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  44.97 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.69 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.91 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.91 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.13 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 		 493 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.91 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.91 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.13 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.24 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.91 
 
 		 483 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.69 
 
 		 483 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.49 
 
 		 491 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  42.08 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.91 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  45.18 
 
 		 478 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.7 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 		 478 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.25 
 
 		 484 aa  362  8e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 485 aa  361  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.81 
 
 		 479 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.65 
 
 		 482 aa  353  5e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  38.98 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.43 
 
 		 482 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.57 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  39.22 
 
 		 482 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.22 
 
 		 482 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.43 
 
 		 482 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.78 
 
 		 493 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  39.22 
 
 		 482 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.22 
 
 		 482 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.43 
 
 		 482 aa  349  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.57 
 
 		 483 aa  349  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  40.93 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.45 
 
 		 483 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.22 
 
 		 480 aa  346  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.12 
 
 		 485 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.45 
 
 		 483 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.39 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.7 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.96 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.39 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.09 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.96 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2142  Aldehyde Dehydrogenase  40.04 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  40.65 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.7 
 
 		 480 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.3 
 
 		 486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.39 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>