More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2831 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
478 aa  966    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  47.11 
 
 
477 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  46.25 
 
 
477 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 
482 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  46.25 
 
 
477 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  45.24 
 
 
477 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
475 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.82 
 
 
476 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  44.96 
 
 
477 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  45.03 
 
 
477 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  45.97 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.04 
 
 
482 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
478 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.83 
 
 
482 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.83 
 
 
482 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.83 
 
 
482 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
482 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
475 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  43.44 
 
 
477 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.61 
 
 
482 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.4 
 
 
482 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.61 
 
 
482 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
476 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  43.82 
 
 
477 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.16 
 
 
496 aa  398  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.04 
 
 
477 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.23 
 
 
485 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  41.19 
 
 
482 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
488 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  42.16 
 
 
480 aa  395  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.52 
 
 
499 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
489 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.72 
 
 
480 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.19 
 
 
482 aa  395  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.31 
 
 
489 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  41.19 
 
 
482 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.22 
 
 
489 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
489 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.4 
 
 
482 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.51 
 
 
483 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  44.92 
 
 
475 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
489 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  43.13 
 
 
482 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
489 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  44.49 
 
 
483 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.29 
 
 
483 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.52 
 
 
499 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.25 
 
 
489 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.31 
 
 
500 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
489 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  43.55 
 
 
476 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
486 aa  392  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.25 
 
 
489 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.46 
 
 
486 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.25 
 
 
489 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.68 
 
 
493 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.86 
 
 
483 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.13 
 
 
479 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.46 
 
 
489 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.31 
 
 
500 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  45.55 
 
 
479 aa  388  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.25 
 
 
489 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  43.47 
 
 
478 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  43.95 
 
 
481 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
489 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.14 
 
 
501 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
489 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.11 
 
 
483 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.72 
 
 
483 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  42.89 
 
 
505 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  45.28 
 
 
479 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
492 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.13 
 
 
480 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  44.26 
 
 
483 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.04 
 
 
489 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.25 
 
 
489 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.92 
 
 
480 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.97 
 
 
489 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.29 
 
 
486 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.15 
 
 
488 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.7 
 
 
480 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
482 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.29 
 
 
484 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
490 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  43.13 
 
 
476 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.7 
 
 
493 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.06 
 
 
485 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  43.16 
 
 
481 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  43.16 
 
 
481 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  45.55 
 
 
477 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
491 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.95 
 
 
484 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.04 
 
 
480 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
485 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
484 aa  381  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  41.31 
 
 
485 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>