More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2116 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  100 
 
 		 477 aa  969    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.16 
 
 		 476 aa  518  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  53.93 
 
 		 477 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  53.72 
 
 		 477 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  53.5 
 
 		 477 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  51.17 
 
 		 482 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  55.22 
 
 		 477 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  52.74 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.69 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  53.09 
 
 		 478 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 		 482 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.52 
 
 		 478 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  52.24 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  51.58 
 
 		 481 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  52.88 
 
 		 478 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  52.77 
 
 		 476 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.11 
 
 		 505 aa  461  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  51.39 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  50.32 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.05 
 
 		 478 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 477 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.32 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  49.36 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  52.12 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  50.42 
 
 		 480 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  51.58 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  50.64 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  51.58 
 
 		 481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 		 481 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  50.86 
 
 		 481 aa  450  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  51.6 
 
 		 477 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 		 481 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  46.91 
 
 		 475 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  49.27 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  48.93 
 
 		 475 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  49.47 
 
 		 481 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.5 
 
 		 485 aa  435  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  47.03 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  47.03 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  47.55 
 
 		 478 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.93 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.12 
 
 		 475 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  48.5 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.13 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  47.88 
 
 		 477 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.01 
 
 		 496 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  49.26 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  46.01 
 
 		 487 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.26 
 
 		 476 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  49.26 
 
 		 478 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.3 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  44.04 
 
 		 478 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.68 
 
 		 486 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.12 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  44.1 
 
 		 476 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.51 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.22 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.12 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.9 
 
 		 489 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.12 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.12 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.22 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.22 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.22 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.12 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.9 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.64 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.95 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.95 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.44 
 
 		 484 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.76 
 
 		 484 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.37 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 493 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.65 
 
 		 489 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.76 
 
 		 490 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.1 
 
 		 500 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.65 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.47 
 
 		 492 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.13 
 
 		 486 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0265  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.09 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.24 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.89 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  40.51 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.51 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.51 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.23 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.51 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.06 
 
 		 483 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.31 
 
 		 490 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.3 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>