More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3739 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 487 aa  999    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.58 
 
 		 475 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.58 
 
 		 475 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  61.68 
 
 		 476 aa  602  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  60.81 
 
 		 475 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  55.65 
 
 		 485 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  55.65 
 
 		 495 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  53.8 
 
 		 482 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  53.4 
 
 		 477 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  53.19 
 
 		 477 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  51.59 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  54.08 
 
 		 477 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  52.98 
 
 		 477 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  51.8 
 
 		 478 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 		 476 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  51.7 
 
 		 481 aa  495  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  50.85 
 
 		 480 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  52.36 
 
 		 477 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  49.26 
 
 		 476 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.64 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  49.26 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  53.22 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  50.64 
 
 		 481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  48.74 
 
 		 482 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  50.85 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.85 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  49.26 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  50.43 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  49.47 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  49.37 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  53.28 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.64 
 
 		 481 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  50.32 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.64 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 481 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  48.62 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.52 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  50.54 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  47.99 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  48.41 
 
 		 479 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.04 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.39 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  47.77 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 		 493 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.05 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.54 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.78 
 
 		 481 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.32 
 
 		 485 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  46.27 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  45.06 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  46.71 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.33 
 
 		 483 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.7 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.67 
 
 		 483 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.2 
 
 		 479 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.88 
 
 		 483 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.01 
 
 		 486 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.88 
 
 		 483 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.46 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.46 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.67 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.67 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.67 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.67 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.67 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.64 
 
 		 476 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.09 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2142  Aldehyde Dehydrogenase  42.03 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.37 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.26 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.15 
 
 		 493 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.3 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.49 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.07 
 
 		 492 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.16 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.94 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.08 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.55 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4032  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.8 
 
 		 481 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.26 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.06 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.66 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  41.2 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.08 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.3 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.68 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  42.37 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2905  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 494 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.82 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.38 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.84 
 
 		 498 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>