More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6851 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  993    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  48.09 
 
 
482 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  47.53 
 
 
477 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
477 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  45.97 
 
 
476 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  46.45 
 
 
477 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  46.93 
 
 
505 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  44.73 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  45.05 
 
 
480 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
481 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  45.55 
 
 
475 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  45.34 
 
 
475 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  46.67 
 
 
481 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  46.45 
 
 
482 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  46.67 
 
 
481 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
478 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  45.97 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.92 
 
 
478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  47.33 
 
 
481 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  43.79 
 
 
481 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  44.28 
 
 
477 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
481 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
475 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  46.61 
 
 
481 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  46.01 
 
 
481 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  44.26 
 
 
477 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.1 
 
 
481 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
481 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  43.67 
 
 
477 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  46.09 
 
 
478 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  46.11 
 
 
479 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 
479 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
478 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  46.51 
 
 
480 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
487 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  44.47 
 
 
477 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.16 
 
 
485 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
493 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  44.07 
 
 
477 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  44.08 
 
 
476 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  43.87 
 
 
476 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
485 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
495 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  43.62 
 
 
477 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
480 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  45.57 
 
 
478 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.33 
 
 
477 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  42.16 
 
 
476 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  42.7 
 
 
478 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  44.49 
 
 
477 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
478 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  45.78 
 
 
478 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
476 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
478 aa  353  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
496 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 
483 aa  346  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  40.9 
 
 
476 aa  340  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.27 
 
 
479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.06 
 
 
485 aa  332  7.000000000000001e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  39.18 
 
 
485 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
500 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.33 
 
 
489 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.12 
 
 
493 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.33 
 
 
489 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.6 
 
 
500 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
489 aa  322  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.85 
 
 
482 aa  322  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.07 
 
 
482 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  39.19 
 
 
483 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.6 
 
 
489 aa  319  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.6 
 
 
489 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.6 
 
 
489 aa  319  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.6 
 
 
489 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.6 
 
 
489 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.74 
 
 
483 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.64 
 
 
482 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.64 
 
 
482 aa  318  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.4 
 
 
489 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
492 aa  317  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
484 aa  316  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.21 
 
 
482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.21 
 
 
482 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
486 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  36.21 
 
 
482 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
503 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.21 
 
 
482 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
509 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.27 
 
 
488 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.86 
 
 
489 aa  313  5.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.21 
 
 
482 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.21 
 
 
482 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.21 
 
 
482 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.21 
 
 
482 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
484 aa  312  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.36 
 
 
503 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.28 
 
 
486 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.83 
 
 
484 aa  311  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.93 
 
 
486 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>