More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1230 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 332 aa  651    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.314412 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.77 
 
 		 332 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000198009 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.4 
 
 		 352 aa  296  4e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.48 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 		 338 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.19 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.9 
 
 		 335 aa  215  7e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  34.72 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  35.31 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 		 347 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 		 332 aa  205  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  33.73 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  34.34 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.01 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  34.94 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 		 334 aa  202  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268081  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.35 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00282517  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.01 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.01 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  33.13 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8933  ABC transporter permease protein  34.76 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467018  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  33.13 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 		 336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.23 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  34.23 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 		 336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  33.43 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  33.63 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  32.84 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  32.84 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 381 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  32.84 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 		 335 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  32.84 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  32.54 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  32.54 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 337 aa  195  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  32.83 
 
 		 336 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.04 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  33.43 
 
 		 336 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  33.43 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  35.31 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.86 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 		 308 aa  192  9e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  32.73 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.82 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 336 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  32.67 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.34 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.34 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.34 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.34 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  34.34 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>