More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1669 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  100 
 
 		 407 aa  825    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  50.13 
 
 		 392 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  48.38 
 
 		 393 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  49.02 
 
 		 401 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  47.77 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  49.24 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  49.63 
 
 		 398 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  48.28 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  47.84 
 
 		 399 aa  332  5e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  48.61 
 
 		 398 aa  332  9e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  49.25 
 
 		 411 aa  332  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  45.74 
 
 		 392 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  46.87 
 
 		 396 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  47.19 
 
 		 390 aa  322  7e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  46.41 
 
 		 410 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  48.15 
 
 		 1305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  47.62 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  46.45 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  47.24 
 
 		 396 aa  316  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  45.14 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  46.06 
 
 		 402 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  46.06 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  44.78 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  43.5 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  46.08 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  46.29 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  45.45 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  44.95 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  46.62 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  44.86 
 
 		 403 aa  298  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  44.47 
 
 		 402 aa  298  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  45.55 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  45.06 
 
 		 393 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  45.06 
 
 		 393 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  45.64 
 
 		 389 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  52.45 
 
 		 385 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  42.82 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  46.6 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  43.83 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  45.5 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  45.06 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  41.4 
 
 		 404 aa  288  8e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  43.58 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  44.39 
 
 		 396 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  44.39 
 
 		 396 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  46.35 
 
 		 1230 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  44.39 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  44.44 
 
 		 392 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  41.77 
 
 		 397 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  44.75 
 
 		 398 aa  282  8.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  43.67 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  47.45 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  47.45 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  41.85 
 
 		 405 aa  279  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  43.86 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  43.14 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  44.17 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  42.89 
 
 		 392 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  42.89 
 
 		 392 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  42.89 
 
 		 392 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  42.64 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  42.64 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  42.64 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  40.69 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  43.44 
 
 		 371 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  46.17 
 
 		 1230 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  43.18 
 
 		 397 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  43.58 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  44.47 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  45.95 
 
 		 1228 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  42.97 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  42.51 
 
 		 413 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  43.86 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  44.09 
 
 		 391 aa  262  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  39.95 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  40.3 
 
 		 382 aa  259  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  41.32 
 
 		 407 aa  259  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  40.15 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  41.39 
 
 		 371 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  43.36 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  41.75 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  42.04 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  43.15 
 
 		 399 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  38.9 
 
 		 401 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  41 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  37.93 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  38.44 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  43.58 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  39.55 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  37.59 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  37.66 
 
 		 401 aa  234  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  34.98 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  37.77 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1346  acetate kinase  38.82 
 
 		 388 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429911  normal  0.010894 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  36.71 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5272  acetate kinase  37.72 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  35.95 
 
 		 404 aa  219  6e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  35.14 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0832  acetate kinase  41.24 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102932  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  35.49 
 
 		 589 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>