More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5272 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5272  acetate kinase  100 
 
 		 386 aa  776    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1346  acetate kinase  89.12 
 
 		 388 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429911  normal  0.010894 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  44.47 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  42.71 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4498  acetate kinase  44.47 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  41.51 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  42.75 
 
 		 402 aa  272  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  42.53 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  43.22 
 
 		 397 aa  269  7e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  41.42 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  42.12 
 
 		 403 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  42.93 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  40.15 
 
 		 394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  37.5 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  36.68 
 
 		 397 aa  256  6e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  42.39 
 
 		 394 aa  255  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  40.86 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  41.73 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  41.22 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  39.69 
 
 		 382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  35.59 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  37.09 
 
 		 398 aa  254  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  36.91 
 
 		 399 aa  254  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  38.97 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  39.32 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  37.84 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  37.84 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  41.71 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  41.24 
 
 		 390 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  40.05 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  37.31 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  38.04 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  38.99 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  37.69 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  41.62 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  36.88 
 
 		 406 aa  246  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  42.05 
 
 		 380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  36.63 
 
 		 406 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  37.53 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  40.51 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  40.35 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  41.01 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  41.22 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  40.35 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  39.45 
 
 		 583 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  40.7 
 
 		 400 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  40.35 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  40.35 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  40.35 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  41.67 
 
 		 396 aa  242  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  40.75 
 
 		 593 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  36.3 
 
 		 403 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  39.65 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  36.3 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  39.35 
 
 		 417 aa  240  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  36.23 
 
 		 399 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  40.3 
 
 		 392 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  36.43 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  42.32 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  40.69 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  34.49 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  36.05 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  36.52 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  36.27 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  34.77 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  37.62 
 
 		 404 aa  237  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2207  acetate kinase  36.61 
 
 		 408 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  41.38 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  40.57 
 
 		 404 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  39.04 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  43.3 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  39.8 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  37.35 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  39 
 
 		 422 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  35.8 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  38.97 
 
 		 394 aa  236  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  38.75 
 
 		 398 aa  236  7e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  36.02 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  38.46 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  39.29 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  42.2 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  39.9 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  39.04 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  40.75 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  40.25 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  38.21 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  40.75 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  34.07 
 
 		 404 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  41.01 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  41.01 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  39.6 
 
 		 589 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  34.07 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  40.51 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  35.09 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0528  acetate kinase  40.75 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  36.78 
 
 		 398 aa  233  6e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  40.97 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  41.21 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  41.12 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  36.92 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>