More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1473 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  100 
 
 
411 aa  844    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  57.5 
 
 
422 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  52.35 
 
 
404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  50.87 
 
 
402 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  49.25 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  50 
 
 
397 aa  402  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  49.38 
 
 
402 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  50.76 
 
 
397 aa  392  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  47.51 
 
 
402 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  46.52 
 
 
399 aa  391  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  47.88 
 
 
396 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  49.26 
 
 
378 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  48.89 
 
 
403 aa  385  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  49.26 
 
 
402 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  47.88 
 
 
401 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  47.88 
 
 
396 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  47.63 
 
 
396 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  47.5 
 
 
404 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  48.65 
 
 
403 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  46.88 
 
 
394 aa  379  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  49.5 
 
 
380 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  47.15 
 
 
397 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  48.11 
 
 
397 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  48 
 
 
396 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  47.88 
 
 
397 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  48.38 
 
 
397 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  46.88 
 
 
397 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  47.88 
 
 
397 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  46.4 
 
 
399 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  47.88 
 
 
397 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  44.61 
 
 
403 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  47.88 
 
 
397 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  47.88 
 
 
397 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  47.88 
 
 
397 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  48.13 
 
 
397 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  46.04 
 
 
399 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  47.88 
 
 
397 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  47.88 
 
 
399 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  47.88 
 
 
396 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  48.13 
 
 
397 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  47.63 
 
 
397 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  46.27 
 
 
398 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  46.15 
 
 
404 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  46.15 
 
 
399 aa  363  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  43.92 
 
 
398 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  43.67 
 
 
398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  46.12 
 
 
406 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  46.31 
 
 
406 aa  362  8e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  50 
 
 
394 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  45.71 
 
 
400 aa  361  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  45.71 
 
 
400 aa  361  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  48.38 
 
 
399 aa  360  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  45.64 
 
 
398 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  45.68 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  45.79 
 
 
401 aa  356  2.9999999999999997e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  47.26 
 
 
399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  47.61 
 
 
408 aa  356  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  45.52 
 
 
409 aa  355  5.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  47 
 
 
400 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  47 
 
 
399 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  47 
 
 
399 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  47.74 
 
 
398 aa  353  4e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  45.27 
 
 
397 aa  353  4e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  44.97 
 
 
401 aa  353  5e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  46.75 
 
 
399 aa  352  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  44.95 
 
 
417 aa  352  8.999999999999999e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  44.31 
 
 
405 aa  352  8.999999999999999e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  46.25 
 
 
399 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  46.25 
 
 
399 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  46.25 
 
 
399 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  46.25 
 
 
399 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  45.59 
 
 
397 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  46.5 
 
 
399 aa  351  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  45.19 
 
 
408 aa  350  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  47.25 
 
 
397 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  44.03 
 
 
406 aa  350  3e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  44.08 
 
 
397 aa  350  3e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01770  acetate kinase  47.93 
 
 
388 aa  349  4e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  46.63 
 
 
398 aa  348  8e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  45.57 
 
 
421 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  43.03 
 
 
394 aa  347  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  45.59 
 
 
421 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  45.2 
 
 
421 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0528  acetate kinase  45.05 
 
 
399 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0217  acetate kinase  47.59 
 
 
410 aa  344  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  47.1 
 
 
407 aa  344  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1870  acetate kinase  44.2 
 
 
401 aa  344  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3044  acetate kinase  48.46 
 
 
386 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  45.05 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  46.97 
 
 
395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  45.66 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  45.05 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  47.59 
 
 
410 aa  343  4e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  44.28 
 
 
404 aa  343  4e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  45.79 
 
 
401 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10414  acetate kinase  44.83 
 
 
385 aa  341  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  45.89 
 
 
413 aa  341  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  43.88 
 
 
421 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  41.69 
 
 
398 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  44.36 
 
 
421 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>