More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2953 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  100 
 
 		 402 aa  800    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  59.3 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  58.79 
 
 		 408 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  54.48 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  56.89 
 
 		 407 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  54.02 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  52.64 
 
 		 380 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  51.9 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  54.94 
 
 		 378 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  48.75 
 
 		 402 aa  391  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  53.03 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  48.12 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  49.26 
 
 		 411 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  52.53 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  46.4 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  48.24 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  47.26 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  47.26 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  52.79 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0528  acetate kinase  51.36 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  51.36 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  47.26 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  47.64 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  47.64 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  47.26 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  47.89 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  51.36 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  46.35 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  47.15 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  47.03 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  46.5 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  47.51 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10414  acetate kinase  50.37 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  47.39 
 
 		 402 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  52.91 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  49 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  47.03 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  49 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  46.23 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  47.28 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  46.23 
 
 		 408 aa  363  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08760  acetate kinase  50.5 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  46.15 
 
 		 399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  47.54 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  45.11 
 
 		 398 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  45.68 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  45.3 
 
 		 421 aa  359  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  45.45 
 
 		 421 aa  358  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  46.9 
 
 		 397 aa  359  6e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  46.67 
 
 		 421 aa  359  6e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  49.37 
 
 		 398 aa  358  8e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  49.63 
 
 		 389 aa  358  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  47.49 
 
 		 397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  43.97 
 
 		 397 aa  356  5e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  45.45 
 
 		 402 aa  356  5e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  44.44 
 
 		 421 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  45.91 
 
 		 397 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  47.41 
 
 		 401 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  46.13 
 
 		 400 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  46.72 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  45.77 
 
 		 403 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  45.32 
 
 		 399 aa  353  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  48.14 
 
 		 398 aa  353  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  44.91 
 
 		 399 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  47.63 
 
 		 396 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  48.62 
 
 		 398 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  44.99 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  44.91 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  46.44 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  47.87 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  43.67 
 
 		 421 aa  352  8e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0204  acetate kinase  49.87 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  42.07 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  45.61 
 
 		 397 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  48.27 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  45.23 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  46.27 
 
 		 404 aa  351  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  44.47 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3693  acetate kinase  55.03 
 
 		 371 aa  350  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  45.84 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  47.16 
 
 		 406 aa  349  5e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  45.91 
 
 		 393 aa  349  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4073  acetate kinase  54.66 
 
 		 375 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  45.61 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  45.27 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  47.52 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  44.72 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  47.52 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  45.61 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  48.37 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  45.61 
 
 		 397 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  45.36 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  45.36 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  45.36 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  42.96 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  46.12 
 
 		 396 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  45.36 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  45.36 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  45.36 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11270  acetate kinase  51.01 
 
 		 395 aa  346  5e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0595808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>