More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3242 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  100 
 
 
402 aa  820    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  79.1 
 
 
404 aa  673    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  81.84 
 
 
402 aa  697    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  64.84 
 
 
403 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  63.09 
 
 
401 aa  528  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  60.25 
 
 
402 aa  498  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  57.29 
 
 
403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  57.29 
 
 
403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  52.37 
 
 
405 aa  435  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  52.36 
 
 
399 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  55.92 
 
 
406 aa  435  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  55.16 
 
 
406 aa  431  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  52.16 
 
 
404 aa  427  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  52.62 
 
 
398 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  52.62 
 
 
398 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  53.92 
 
 
401 aa  424  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  51 
 
 
397 aa  421  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  53.42 
 
 
397 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  51.87 
 
 
398 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  50.5 
 
 
422 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  52.91 
 
 
408 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  53.15 
 
 
401 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  50.5 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  52.74 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  50.75 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  51.77 
 
 
398 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  50.75 
 
 
397 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  50.5 
 
 
398 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  49.5 
 
 
399 aa  412  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  51 
 
 
399 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  49.75 
 
 
394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  51.12 
 
 
395 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  49 
 
 
399 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  51.9 
 
 
396 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  49.49 
 
 
396 aa  395  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  50.37 
 
 
404 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  51.24 
 
 
401 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  50.51 
 
 
397 aa  396  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  49.75 
 
 
396 aa  393  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  49.26 
 
 
421 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  50 
 
 
396 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  47.51 
 
 
411 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  48.63 
 
 
394 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  49.5 
 
 
397 aa  388  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  47.38 
 
 
380 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  49.36 
 
 
397 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  50.37 
 
 
397 aa  385  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  48.87 
 
 
409 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  47.63 
 
 
408 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  49.13 
 
 
404 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  48.4 
 
 
421 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  48.85 
 
 
397 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  48.85 
 
 
397 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  48.85 
 
 
397 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  48.85 
 
 
397 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  47.65 
 
 
421 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  48.85 
 
 
397 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  47.65 
 
 
421 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  46.93 
 
 
406 aa  383  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  48.85 
 
 
397 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  47.74 
 
 
397 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  48.13 
 
 
399 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  47.88 
 
 
398 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  48.35 
 
 
397 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  48.6 
 
 
397 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  46.67 
 
 
421 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  47.38 
 
 
417 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  46.4 
 
 
402 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  48.01 
 
 
398 aa  380  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  47.16 
 
 
421 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  49.5 
 
 
394 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  47.65 
 
 
421 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  47.41 
 
 
421 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  48.09 
 
 
397 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  48.09 
 
 
396 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  49.5 
 
 
396 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  48.61 
 
 
399 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1870  acetate kinase  47.03 
 
 
401 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  47.98 
 
 
407 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  45.82 
 
 
414 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  47.38 
 
 
398 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  44.83 
 
 
420 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  45.25 
 
 
394 aa  363  3e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  46.13 
 
 
397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  48.25 
 
 
395 aa  362  6e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  47.61 
 
 
386 aa  362  8e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  44.95 
 
 
417 aa  362  9e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  46.13 
 
 
398 aa  358  7e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1280  acetate kinase  44.58 
 
 
418 aa  355  1e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  47.39 
 
 
398 aa  354  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  46.88 
 
 
398 aa  352  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11270  acetate kinase  47.37 
 
 
395 aa  352  5e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0595808  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  46.98 
 
 
398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  45.69 
 
 
404 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  45.55 
 
 
452 aa  351  1e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  46.77 
 
 
400 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  45.89 
 
 
399 aa  349  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  46.77 
 
 
399 aa  348  8e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  44.53 
 
 
398 aa  348  1e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  44.89 
 
 
404 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>