More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3761 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  100 
 
 
386 aa  759    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  67.25 
 
 
398 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  63.59 
 
 
399 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  62.92 
 
 
389 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10414  acetate kinase  61.42 
 
 
385 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  62.09 
 
 
408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  59.09 
 
 
409 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  61.62 
 
 
407 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0528  acetate kinase  58.88 
 
 
399 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  58.63 
 
 
399 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  58.63 
 
 
399 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  57.14 
 
 
399 aa  422  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  61.33 
 
 
378 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  59.64 
 
 
395 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0204  acetate kinase  62.57 
 
 
386 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128716  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08760  acetate kinase  53.45 
 
 
403 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0722  acetate kinase  50.75 
 
 
409 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0141081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  55 
 
 
380 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  53.03 
 
 
402 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  52.41 
 
 
394 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  51.79 
 
 
402 aa  378  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0623  acetate kinase  51.15 
 
 
409 aa  380  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  50.63 
 
 
401 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11270  acetate kinase  54.23 
 
 
395 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0595808  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3693  acetate kinase  59.42 
 
 
371 aa  363  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  48.23 
 
 
401 aa  362  5.0000000000000005e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  47.61 
 
 
402 aa  362  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4073  acetate kinase  58.89 
 
 
375 aa  359  4e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  48.98 
 
 
402 aa  356  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  45.69 
 
 
404 aa  355  6.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  46.62 
 
 
397 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  44.84 
 
 
399 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  47.61 
 
 
398 aa  347  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  45.09 
 
 
397 aa  346  5e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  46.62 
 
 
421 aa  345  7e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  47.62 
 
 
403 aa  345  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  47.62 
 
 
403 aa  344  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  44.08 
 
 
417 aa  343  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  45.59 
 
 
398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  45.09 
 
 
398 aa  342  7e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  46.12 
 
 
397 aa  340  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  45.09 
 
 
411 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  44.85 
 
 
422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  45.43 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  45.34 
 
 
399 aa  339  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  44.42 
 
 
421 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  45.36 
 
 
421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  43.94 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  44.19 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  45.34 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  44.44 
 
 
397 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  44.25 
 
 
397 aa  335  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  43.94 
 
 
397 aa  334  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  43.94 
 
 
397 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  43.94 
 
 
397 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  43.94 
 
 
397 aa  333  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  43.94 
 
 
397 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  44.19 
 
 
397 aa  333  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  43.94 
 
 
397 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  43.94 
 
 
397 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  43.69 
 
 
397 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  46.23 
 
 
406 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  44.36 
 
 
421 aa  332  9e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  44.47 
 
 
401 aa  332  9e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  44.7 
 
 
396 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  45.36 
 
 
421 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  44.08 
 
 
398 aa  331  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  41.46 
 
 
404 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3238  acetate kinase  50.77 
 
 
386 aa  332  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  44.19 
 
 
394 aa  330  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  43.8 
 
 
403 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3044  acetate kinase  50 
 
 
386 aa  329  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  45.59 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  46.6 
 
 
404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  44.53 
 
 
399 aa  329  6e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  46.48 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  44.61 
 
 
421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1870  acetate kinase  44.03 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  45.73 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  45.15 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  43.43 
 
 
395 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  49.35 
 
 
583 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  42.57 
 
 
397 aa  326  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  44.58 
 
 
396 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  44.58 
 
 
397 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  44.3 
 
 
394 aa  325  1e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  45.71 
 
 
414 aa  325  1e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  44.17 
 
 
421 aa  323  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  42.57 
 
 
398 aa  322  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  42.57 
 
 
398 aa  322  6e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  44.64 
 
 
396 aa  322  6e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  44.67 
 
 
396 aa  322  8e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  43.36 
 
 
421 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  44.16 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  41.81 
 
 
399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  46.19 
 
 
398 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  43.89 
 
 
398 aa  319  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  44.72 
 
 
420 aa  319  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  45.48 
 
 
404 aa  318  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  43.07 
 
 
408 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>