More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0343 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  81.84 
 
 
402 aa  697    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  79.6 
 
 
404 aa  675    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  100 
 
 
402 aa  828    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  63.84 
 
 
403 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  63.59 
 
 
401 aa  531  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  60.5 
 
 
402 aa  504  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  53.1 
 
 
404 aa  435  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  51.37 
 
 
405 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  53.96 
 
 
403 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  53.96 
 
 
403 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  53.48 
 
 
398 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  51.24 
 
 
399 aa  424  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  53.73 
 
 
408 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  53.4 
 
 
397 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  53.71 
 
 
406 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  51 
 
 
397 aa  420  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  51.49 
 
 
394 aa  419  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  54.34 
 
 
397 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  52.74 
 
 
399 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  51.24 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  50.75 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  52.11 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  51.37 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  51.37 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  51 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  51.15 
 
 
422 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  52.91 
 
 
398 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  51.49 
 
 
406 aa  410  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  51.61 
 
 
404 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  51.39 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  51.11 
 
 
398 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  49.75 
 
 
397 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  50.88 
 
 
408 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  51.87 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  49.63 
 
 
380 aa  398  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  50.87 
 
 
401 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  50.12 
 
 
397 aa  395  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  49.38 
 
 
411 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  49.88 
 
 
395 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  51.65 
 
 
394 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  47.75 
 
 
396 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  48.75 
 
 
396 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  50.5 
 
 
396 aa  388  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  49.37 
 
 
409 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  48.63 
 
 
404 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  48.15 
 
 
421 aa  381  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  50.25 
 
 
397 aa  383  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  48.25 
 
 
396 aa  385  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  49.75 
 
 
401 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  47.67 
 
 
421 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  47.38 
 
 
414 aa  376  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  47.41 
 
 
421 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  46.91 
 
 
421 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  47.65 
 
 
421 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  47.84 
 
 
397 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  48.63 
 
 
397 aa  377  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  49.63 
 
 
399 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  48.77 
 
 
399 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  45.66 
 
 
394 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  48.13 
 
 
396 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  47.03 
 
 
421 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  47.63 
 
 
398 aa  371  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  46.77 
 
 
398 aa  369  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  46.42 
 
 
421 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  46.32 
 
 
406 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  45.68 
 
 
421 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  47.39 
 
 
402 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  46.25 
 
 
397 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  46.25 
 
 
397 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  46.25 
 
 
397 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  46.25 
 
 
397 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  46.25 
 
 
397 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  46.25 
 
 
397 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  45.39 
 
 
398 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  45.14 
 
 
417 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  46.25 
 
 
397 aa  364  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  46 
 
 
397 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  47.07 
 
 
397 aa  364  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  49 
 
 
407 aa  363  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  48.87 
 
 
378 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  46 
 
 
397 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  46 
 
 
397 aa  363  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  45.81 
 
 
420 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  46.56 
 
 
452 aa  362  5.0000000000000005e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  48.5 
 
 
395 aa  360  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1870  acetate kinase  46.53 
 
 
401 aa  358  9.999999999999999e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  45 
 
 
417 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  48.98 
 
 
386 aa  356  5e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0328  acetate kinase  46.56 
 
 
409 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000406693 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1280  acetate kinase  45.12 
 
 
418 aa  351  1e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25160  acetate kinase  46.04 
 
 
403 aa  352  1e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.748189  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  44 
 
 
394 aa  349  5e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  45.14 
 
 
398 aa  349  6e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  45.11 
 
 
398 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  45.91 
 
 
399 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  47.75 
 
 
400 aa  346  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  48.13 
 
 
398 aa  346  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  47.13 
 
 
398 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  46.29 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  45.86 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>