More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0642 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  100 
 
 		 399 aa  801    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  63.2 
 
 		 409 aa  497  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  61.11 
 
 		 395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  60.71 
 
 		 407 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  58.54 
 
 		 408 aa  458  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0722  acetate kinase  56.82 
 
 		 409 aa  459  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0141081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  55.86 
 
 		 399 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0623  acetate kinase  54.95 
 
 		 409 aa  431  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  57.14 
 
 		 386 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08760  acetate kinase  54.06 
 
 		 403 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  54.8 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  54.02 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0528  acetate kinase  53.13 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  52.88 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  52.88 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10414  acetate kinase  50.9 
 
 		 385 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  51.94 
 
 		 389 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  50.75 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  51.37 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  51.78 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  48.13 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  48.24 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0204  acetate kinase  51.39 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  49.37 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  50.89 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  46.98 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  47.86 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  49.63 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  49 
 
 		 404 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  48.99 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  47.88 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  45.55 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  48.61 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  47.73 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  48.11 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  48.72 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  48.36 
 
 		 397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11270  acetate kinase  51.26 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0595808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  45.29 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  45.71 
 
 		 394 aa  361  2e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  49.37 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  47.61 
 
 		 405 aa  358  6e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  48.1 
 
 		 396 aa  358  7e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  47.34 
 
 		 395 aa  358  7e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  47.85 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  47.73 
 
 		 398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  47.24 
 
 		 406 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  47.34 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  47.12 
 
 		 403 aa  353  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  47.12 
 
 		 403 aa  353  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  47.01 
 
 		 413 aa  352  5e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  46.25 
 
 		 399 aa  350  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  46.62 
 
 		 421 aa  348  9e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  45.94 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  44.86 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  45.09 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  46.1 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  45.75 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  44.61 
 
 		 403 aa  346  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3044  acetate kinase  48.82 
 
 		 386 aa  345  6e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  44.27 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3238  acetate kinase  49.75 
 
 		 386 aa  345  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  47.12 
 
 		 397 aa  345  8.999999999999999e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  45.94 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  47.36 
 
 		 401 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  45.59 
 
 		 398 aa  344  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  45.73 
 
 		 406 aa  344  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  45.69 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  45.69 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  45.69 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  45.69 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  45.69 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  45.69 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  45.69 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  45.69 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  46.25 
 
 		 400 aa  342  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  45.43 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  46.27 
 
 		 400 aa  342  8e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  46 
 
 		 399 aa  342  9e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  45.75 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  45.75 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  45.75 
 
 		 399 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  45.75 
 
 		 399 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  45.75 
 
 		 399 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  45.75 
 
 		 399 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  45.64 
 
 		 398 aa  338  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  45.71 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  45.2 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  45.25 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  45.89 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  44.42 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  46.98 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  45.09 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  47.1 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  45.71 
 
 		 396 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  44.42 
 
 		 396 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  44.11 
 
 		 421 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  44.47 
 
 		 421 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1870  acetate kinase  45.07 
 
 		 401 aa  334  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>