More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0920 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  100 
 
 		 414 aa  840    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  78.09 
 
 		 414 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  49.75 
 
 		 399 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  51.52 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  51.52 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  50.25 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  49.62 
 
 		 417 aa  405  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  50 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  48.74 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  48.48 
 
 		 398 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  49.36 
 
 		 397 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  49.11 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  49.62 
 
 		 397 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  48.85 
 
 		 397 aa  391  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  49.36 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  48.85 
 
 		 397 aa  391  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  47.97 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  48.85 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  48.85 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  48.85 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  46.46 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  49.11 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  46.38 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  48.85 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  50.37 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  47.1 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  48.85 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  45.8 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  46.95 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  47.73 
 
 		 405 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  47.46 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  47.46 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  47.33 
 
 		 395 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  48.09 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  44.84 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  46.68 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  45.45 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  47.21 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  47.21 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  47.46 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  44.7 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  47.21 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  47.21 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  44.64 
 
 		 404 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  45.32 
 
 		 401 aa  363  2e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  46.55 
 
 		 408 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  45.71 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  45.92 
 
 		 397 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  44.28 
 
 		 421 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  44.47 
 
 		 397 aa  353  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  44.44 
 
 		 398 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  43.28 
 
 		 421 aa  352  7e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  44.36 
 
 		 421 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  45.69 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  46.23 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  43.69 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  43.89 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  44.09 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  43.25 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  44.86 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  43 
 
 		 421 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  43.39 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  44.64 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  43.65 
 
 		 398 aa  342  5.999999999999999e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  44.3 
 
 		 408 aa  342  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  44.3 
 
 		 409 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  44.13 
 
 		 421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  43.15 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0168  acetate kinase  44.7 
 
 		 397 aa  339  5e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.14758  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  44.42 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  42.64 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  44.3 
 
 		 422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  42.68 
 
 		 404 aa  336  5.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  41.06 
 
 		 417 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  42.35 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  44.02 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2294  acetate kinase  43.99 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  46.15 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1834  acetate kinase  44.81 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000432075  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  41.27 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  45.89 
 
 		 415 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  44.62 
 
 		 414 aa  330  2e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  44.76 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1249  acetate kinase  42.93 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.407585  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1269  acetate kinase  40.91 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  43 
 
 		 394 aa  330  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  46.39 
 
 		 395 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  40.45 
 
 		 406 aa  329  6e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  40.61 
 
 		 394 aa  329  7e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  44.5 
 
 		 395 aa  329  7e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  45.39 
 
 		 425 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  45.15 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  45.14 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  42.82 
 
 		 411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  42.11 
 
 		 398 aa  326  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  45.41 
 
 		 407 aa  326  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1280  acetate kinase  40.77 
 
 		 418 aa  326  5e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  44.58 
 
 		 380 aa  325  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>