More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1669 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  83.38 
 
 
399 aa  701    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  85.68 
 
 
398 aa  720    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  84.38 
 
 
399 aa  706    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  84.13 
 
 
400 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  86.68 
 
 
398 aa  729    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  86.4 
 
 
399 aa  723    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  80.4 
 
 
398 aa  674    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  83.12 
 
 
413 aa  695    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  84.38 
 
 
399 aa  706    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  83.88 
 
 
399 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  83.88 
 
 
399 aa  702    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  84.38 
 
 
399 aa  706    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  82.62 
 
 
400 aa  686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  84.38 
 
 
399 aa  706    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  100 
 
 
398 aa  817    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  84.13 
 
 
399 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  80.86 
 
 
399 aa  682    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  64.48 
 
 
404 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  64.09 
 
 
402 aa  531  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  65.06 
 
 
398 aa  527  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  61.9 
 
 
400 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  61.9 
 
 
400 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  61.9 
 
 
400 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  61.9 
 
 
400 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  62.16 
 
 
400 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  60.65 
 
 
400 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  61.9 
 
 
400 aa  514  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  61.9 
 
 
400 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.340235 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  510  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  510  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  510  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  61.65 
 
 
400 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  63.04 
 
 
398 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  510  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  62.53 
 
 
398 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  60.15 
 
 
400 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1484  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  502  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.209908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  62.53 
 
 
398 aa  503  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2780  acetate kinase  61.65 
 
 
400 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0653743  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  60.15 
 
 
398 aa  490  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  57.25 
 
 
393 aa  451  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  54.43 
 
 
412 aa  444  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  56.5 
 
 
421 aa  444  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  55.97 
 
 
397 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  55.86 
 
 
397 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0382  acetate kinase  52.13 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  53.98 
 
 
398 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  48.61 
 
 
397 aa  390  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  50.76 
 
 
415 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  49.87 
 
 
394 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  49.87 
 
 
394 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  50.51 
 
 
425 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  50.51 
 
 
425 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  47.86 
 
 
401 aa  382  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  49.23 
 
 
398 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  48.48 
 
 
398 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  50.75 
 
 
395 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  48.61 
 
 
398 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  50.64 
 
 
449 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  46.97 
 
 
398 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  46.72 
 
 
398 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  47.62 
 
 
403 aa  369  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  49.62 
 
 
394 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  47.62 
 
 
403 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  49.49 
 
 
405 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0833  acetate kinase  51.52 
 
 
414 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528826  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1078  acetate kinase  51.52 
 
 
414 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458845  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2006  acetate kinase  51.52 
 
 
414 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  48.48 
 
 
398 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  50 
 
 
401 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  48.35 
 
 
403 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  48.24 
 
 
421 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  50.25 
 
 
395 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2309  acetate kinase  47.72 
 
 
396 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  46.97 
 
 
395 aa  365  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  47.49 
 
 
421 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  46.41 
 
 
417 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  48.37 
 
 
396 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  47.49 
 
 
398 aa  362  8e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  48.74 
 
 
401 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  45.84 
 
 
399 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  45.29 
 
 
421 aa  359  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1379  acetate kinase  49.49 
 
 
408 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  44.84 
 
 
397 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  46.75 
 
 
406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  47.38 
 
 
406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  46.73 
 
 
421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  47 
 
 
408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  46.73 
 
 
394 aa  356  5e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0217  acetate kinase  48.84 
 
 
410 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  48.98 
 
 
410 aa  355  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  47.96 
 
 
421 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  47.41 
 
 
402 aa  354  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>