More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2780 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  86 
 
 		 400 aa  721    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  86 
 
 		 400 aa  721    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  86 
 
 		 400 aa  721    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  86 
 
 		 400 aa  721    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  86 
 
 		 400 aa  721    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2780  acetate kinase  100 
 
 		 400 aa  823    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0653743  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  89.25 
 
 		 400 aa  750    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  86 
 
 		 400 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  92 
 
 		 400 aa  764    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  85.75 
 
 		 400 aa  725    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  716    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  86 
 
 		 400 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  86 
 
 		 400 aa  721    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  85.75 
 
 		 400 aa  726    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  723    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1484  acetate kinase  97.5 
 
 		 400 aa  783    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.209908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  86 
 
 		 400 aa  721    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  86 
 
 		 400 aa  725    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  73.87 
 
 		 398 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0382  acetate kinase  70 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  73.05 
 
 		 398 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  71.86 
 
 		 398 aa  598  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  69.67 
 
 		 398 aa  591  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  71.61 
 
 		 398 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  69.73 
 
 		 402 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  63.41 
 
 		 400 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  63.16 
 
 		 399 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  63.16 
 
 		 399 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  63.16 
 
 		 399 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  63.5 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  63.16 
 
 		 399 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  63.16 
 
 		 399 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  63.16 
 
 		 399 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  63.41 
 
 		 399 aa  524  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  62.91 
 
 		 398 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  63.16 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  63.41 
 
 		 400 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  63.75 
 
 		 399 aa  519  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  62.66 
 
 		 398 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  62.16 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  62.41 
 
 		 398 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  61.65 
 
 		 398 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  58.1 
 
 		 404 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  52.13 
 
 		 412 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  51.54 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  52.11 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  52.74 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  50 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  51.74 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  46.98 
 
 		 403 aa  353  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  46.98 
 
 		 403 aa  353  4e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  45.5 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  45.25 
 
 		 398 aa  352  8e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  47.37 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  46.12 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  46.6 
 
 		 409 aa  349  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  48.88 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  46.73 
 
 		 401 aa  346  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  47.62 
 
 		 395 aa  345  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  45.73 
 
 		 398 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  46.25 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  45.5 
 
 		 399 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  46.94 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  46.88 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  47.62 
 
 		 394 aa  338  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  45.39 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  45 
 
 		 398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  44.19 
 
 		 398 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  45.23 
 
 		 397 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  46.33 
 
 		 449 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  46.62 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  46.31 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  46.48 
 
 		 404 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  46.12 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  45.75 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1379  acetate kinase  48.35 
 
 		 408 aa  330  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  46.19 
 
 		 425 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  44.03 
 
 		 405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  42.21 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  45.94 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  43.97 
 
 		 398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  44.5 
 
 		 396 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  45.14 
 
 		 399 aa  325  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  44.44 
 
 		 397 aa  325  9e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  44 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  46.12 
 
 		 405 aa  323  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41120  acetate kinase  46.37 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0461537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  46 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  44.19 
 
 		 404 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  45.32 
 
 		 411 aa  322  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  43.43 
 
 		 421 aa  322  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0833  acetate kinase  46.73 
 
 		 414 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528826  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  44.58 
 
 		 421 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1078  acetate kinase  46.73 
 
 		 414 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2006  acetate kinase  46.73 
 
 		 414 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>