More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1379 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1379  acetate kinase  100 
 
 		 408 aa  813    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  65.28 
 
 		 405 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  64.96 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0833  acetate kinase  62.03 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528826  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1078  acetate kinase  62.03 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2006  acetate kinase  61.4 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  57.47 
 
 		 403 aa  428  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  57.25 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  50.77 
 
 		 413 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  49.74 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  50.89 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  51.28 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  51.28 
 
 		 415 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  51.28 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  49.87 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  49.36 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  49.36 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  50.76 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  49.36 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  49.36 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  50.25 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  49.49 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  48.85 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  48.6 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  49.49 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  48.6 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  48.6 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3504  propionate/acetate kinase  52.58 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  52.84 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3433  propionate/acetate kinase  52.32 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3430  propionate/acetate kinase  52.32 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  51.29 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  49.49 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3600  propionate/acetate kinase  52.06 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3537  propionate/acetate kinase  52.32 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.831906  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02982  propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic  51.16 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0588  acetate kinase  51.16 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3411  propionate/acetate kinase  51.16 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02933  hypothetical protein  51.16 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3589  propionate/acetate kinase  50.9 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3242  propionate/acetate kinase  50.9 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4428  propionate/acetate kinase  51.16 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0208256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3303  propionate/acetate kinase  51.16 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.307488  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  48.02 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  49.87 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  55.41 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0583  propionate/acetate kinase  50.9 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3910  acetate kinase  48.71 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  50.52 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  51.15 
 
 		 394 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  50.89 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  47.36 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  47.06 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  46.85 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  48.87 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  49.62 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1591  acetate kinase  50.52 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.390767  normal  0.0967688 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  47.24 
 
 		 398 aa  352  7e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  49.37 
 
 		 398 aa  352  7e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  46.84 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  52.55 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  47.87 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4051  acetate kinase  48.23 
 
 		 411 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  48.86 
 
 		 400 aa  349  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41120  acetate kinase  52.44 
 
 		 399 aa  349  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0461537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  47.1 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  47.1 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  47.1 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  47.1 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  47.1 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  47.1 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  47.1 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  47.1 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  47.1 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  46.85 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  46.85 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  46.85 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  46.85 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  46.85 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  46.33 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  46.1 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  47.18 
 
 		 397 aa  345  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4009  acetate kinase  47.98 
 
 		 411 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  47.24 
 
 		 403 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  48.12 
 
 		 398 aa  344  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  47.62 
 
 		 398 aa  345  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  47.24 
 
 		 403 aa  345  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  48.36 
 
 		 399 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  46.33 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  46.87 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  46.53 
 
 		 397 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  46.53 
 
 		 397 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  46.53 
 
 		 397 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  46.79 
 
 		 397 aa  342  9e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  46.79 
 
 		 397 aa  342  9e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  46.53 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  45.59 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>