More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02933 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02982  propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic  100 
 
 
406 aa  832    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0588  acetate kinase  100 
 
 
402 aa  822    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4428  propionate/acetate kinase  99.25 
 
 
402 aa  813    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0208256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02933  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  832    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3600  propionate/acetate kinase  82.34 
 
 
402 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3504  propionate/acetate kinase  81.84 
 
 
402 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3303  propionate/acetate kinase  100 
 
 
402 aa  822    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.307488  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3242  propionate/acetate kinase  99 
 
 
402 aa  816    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  76.87 
 
 
402 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3430  propionate/acetate kinase  82.34 
 
 
402 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3537  propionate/acetate kinase  82.59 
 
 
402 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.831906  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3589  propionate/acetate kinase  99.5 
 
 
402 aa  820    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3411  propionate/acetate kinase  99.5 
 
 
402 aa  818    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3433  propionate/acetate kinase  82.59 
 
 
402 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0583  propionate/acetate kinase  99.25 
 
 
402 aa  813    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  52.94 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  52.82 
 
 
449 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  45.66 
 
 
412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  48.96 
 
 
398 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1379  acetate kinase  51.16 
 
 
408 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2006  acetate kinase  50.75 
 
 
414 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  46.33 
 
 
395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0833  acetate kinase  51.54 
 
 
414 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528826  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1078  acetate kinase  51.54 
 
 
414 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458845  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  51.52 
 
 
405 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  48.72 
 
 
394 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  47.44 
 
 
395 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  48.72 
 
 
394 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  45.82 
 
 
398 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  46.7 
 
 
401 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  46.31 
 
 
399 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  44.44 
 
 
399 aa  346  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  47.59 
 
 
395 aa  346  5e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  45.55 
 
 
404 aa  346  5e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  42.79 
 
 
398 aa  345  8e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  45.84 
 
 
397 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  45.8 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  45.55 
 
 
413 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2309  acetate kinase  46.92 
 
 
396 aa  343  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  45.55 
 
 
399 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  45.55 
 
 
399 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  45.55 
 
 
399 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  45.55 
 
 
399 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  47.55 
 
 
425 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  43.88 
 
 
397 aa  341  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  44.97 
 
 
399 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  45.73 
 
 
399 aa  342  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  45.06 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  45.48 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  45.48 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  45.55 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  44.84 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  46.21 
 
 
398 aa  339  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  47.29 
 
 
425 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  45.59 
 
 
398 aa  339  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  45.82 
 
 
398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  44.75 
 
 
398 aa  338  9e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  45.84 
 
 
396 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  45 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  49.74 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  45.86 
 
 
415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  43.58 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  44.97 
 
 
399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  45.57 
 
 
398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  43.58 
 
 
397 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  43.94 
 
 
397 aa  335  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  43.69 
 
 
397 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  43.69 
 
 
397 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  43.69 
 
 
397 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  43.69 
 
 
397 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  43.69 
 
 
397 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  43.69 
 
 
397 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  43.69 
 
 
397 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  43.88 
 
 
398 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  46.12 
 
 
397 aa  332  5e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  44.5 
 
 
393 aa  332  7.000000000000001e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  43.58 
 
 
397 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3910  acetate kinase  46.63 
 
 
411 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  41.81 
 
 
397 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  44.22 
 
 
404 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  43.86 
 
 
405 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  44.39 
 
 
403 aa  330  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  43.19 
 
 
404 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  44.39 
 
 
403 aa  331  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  44.27 
 
 
399 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  44.58 
 
 
396 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  44.42 
 
 
398 aa  330  3e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  45.45 
 
 
400 aa  330  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  43.97 
 
 
404 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  43.97 
 
 
404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  43.97 
 
 
404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  43.97 
 
 
404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  43.94 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  42.39 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  45.75 
 
 
421 aa  326  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  44.1 
 
 
398 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  45.2 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  44.19 
 
 
402 aa  326  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  44.25 
 
 
404 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  45.2 
 
 
400 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>