More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3311 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  100 
 
 
404 aa  829    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  69.1 
 
 
399 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  67.59 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  67.59 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  67.34 
 
 
399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  66.83 
 
 
399 aa  568  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  66.75 
 
 
400 aa  566  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  67.59 
 
 
400 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  65.74 
 
 
398 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  66.08 
 
 
399 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  66.08 
 
 
399 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  66.08 
 
 
399 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  66.58 
 
 
413 aa  557  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  66.08 
 
 
399 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  65.83 
 
 
399 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  65.74 
 
 
398 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  63.98 
 
 
398 aa  542  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  64.48 
 
 
398 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  61.56 
 
 
398 aa  489  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  59.45 
 
 
402 aa  489  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  59.19 
 
 
398 aa  472  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  58.35 
 
 
400 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  59.09 
 
 
398 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  59.45 
 
 
398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  57.36 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  57.07 
 
 
400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  56.61 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  57.11 
 
 
400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  57.11 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  58.15 
 
 
398 aa  466  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  56.86 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1484  acetate kinase  58.85 
 
 
400 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.209908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2780  acetate kinase  58.1 
 
 
400 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0653743  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  56.86 
 
 
400 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  55.11 
 
 
397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  57 
 
 
397 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  55.25 
 
 
421 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0382  acetate kinase  53.48 
 
 
400 aa  429  1e-119  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  52.66 
 
 
412 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  49.87 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  51.39 
 
 
393 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  48.99 
 
 
397 aa  393  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  49.12 
 
 
401 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  48.61 
 
 
398 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  48.74 
 
 
398 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  48.98 
 
 
403 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  47.47 
 
 
398 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  45.59 
 
 
398 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  45.84 
 
 
398 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  47.47 
 
 
399 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  47.61 
 
 
396 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  49.37 
 
 
395 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  49.24 
 
 
425 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  49.24 
 
 
425 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  48.98 
 
 
415 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  47.47 
 
 
398 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  48.36 
 
 
394 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  47.1 
 
 
401 aa  378  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  47.61 
 
 
394 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  47.36 
 
 
399 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  45.09 
 
 
397 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  47.19 
 
 
400 aa  368  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  45.89 
 
 
403 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  46.62 
 
 
405 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  46.98 
 
 
398 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  49.38 
 
 
405 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  45.89 
 
 
403 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  45.23 
 
 
399 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  49.36 
 
 
395 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  45.59 
 
 
397 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  45.14 
 
 
398 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  47.19 
 
 
400 aa  368  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  44.84 
 
 
397 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  46.98 
 
 
404 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  44.84 
 
 
397 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  44.84 
 
 
397 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  44.84 
 
 
397 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  44.84 
 
 
397 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  46.21 
 
 
395 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  44.84 
 
 
397 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0833  acetate kinase  50.76 
 
 
414 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528826  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1078  acetate kinase  50.76 
 
 
414 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458845  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2006  acetate kinase  50.76 
 
 
414 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  44.84 
 
 
397 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  44.81 
 
 
397 aa  365  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  45.09 
 
 
397 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  44.84 
 
 
397 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>