More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3238 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3044  acetate kinase  89.52 
 
 
386 aa  651    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3238  acetate kinase  100 
 
 
386 aa  771    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01770  acetate kinase  62.82 
 
 
388 aa  463  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  50.25 
 
 
398 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  49.37 
 
 
401 aa  382  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  50.25 
 
 
402 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  54.55 
 
 
380 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  51 
 
 
403 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  52.94 
 
 
408 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  51 
 
 
403 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  49.87 
 
 
399 aa  363  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  51.66 
 
 
394 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  48.75 
 
 
406 aa  363  3e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  48.1 
 
 
396 aa  360  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  48.99 
 
 
395 aa  358  7e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  47.85 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  52.06 
 
 
395 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  48.73 
 
 
422 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  47.09 
 
 
396 aa  353  2e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  45.11 
 
 
399 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  47.63 
 
 
405 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  49.74 
 
 
398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  46.48 
 
 
404 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  48.39 
 
 
411 aa  352  5.9999999999999994e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  48 
 
 
399 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  49.74 
 
 
409 aa  351  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  47.25 
 
 
406 aa  351  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  48.74 
 
 
401 aa  351  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  47.01 
 
 
401 aa  351  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  46.65 
 
 
401 aa  350  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  47 
 
 
402 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  45.64 
 
 
404 aa  348  7e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  44.72 
 
 
394 aa  347  1e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  47.01 
 
 
396 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  46.75 
 
 
397 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  45.5 
 
 
404 aa  348  1e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  47.27 
 
 
397 aa  347  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  47.19 
 
 
398 aa  346  3e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  47.36 
 
 
397 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  47.01 
 
 
397 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  50.25 
 
 
399 aa  346  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  47.01 
 
 
397 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  47.01 
 
 
397 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  47.01 
 
 
397 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  47.01 
 
 
397 aa  345  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  47.01 
 
 
397 aa  345  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  47.01 
 
 
397 aa  345  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  43.54 
 
 
397 aa  345  8e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  46.75 
 
 
397 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  46.75 
 
 
397 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  46.75 
 
 
397 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  43.58 
 
 
397 aa  342  5e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  47.94 
 
 
400 aa  342  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  47.94 
 
 
400 aa  342  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  46.35 
 
 
396 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  47.5 
 
 
397 aa  342  9e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  51.53 
 
 
386 aa  341  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  42.96 
 
 
399 aa  341  1e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  45.11 
 
 
398 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  46 
 
 
408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  44.86 
 
 
398 aa  339  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  43.54 
 
 
398 aa  339  5e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  46.63 
 
 
399 aa  339  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  46.63 
 
 
399 aa  338  7e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  46.63 
 
 
399 aa  338  7e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  46.27 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  46.27 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  50 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  46.27 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  46.27 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  45.34 
 
 
417 aa  336  5e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  48.48 
 
 
398 aa  336  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  45.5 
 
 
402 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  45.66 
 
 
421 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  48.36 
 
 
402 aa  335  9e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  44.33 
 
 
398 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  48.34 
 
 
401 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  46 
 
 
399 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  46.1 
 
 
413 aa  333  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  45.77 
 
 
400 aa  333  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  48.44 
 
 
389 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0528  acetate kinase  48.35 
 
 
399 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  43.97 
 
 
398 aa  331  1e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  48.07 
 
 
395 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  48.35 
 
 
399 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  48.35 
 
 
399 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08760  acetate kinase  48.1 
 
 
403 aa  330  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  45.8 
 
 
397 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  48.98 
 
 
395 aa  329  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  45.43 
 
 
399 aa  329  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  44.64 
 
 
403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  49.87 
 
 
398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  49.09 
 
 
378 aa  329  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  48.07 
 
 
394 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  46.84 
 
 
399 aa  328  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  47.09 
 
 
398 aa  328  9e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  46.15 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  45.84 
 
 
404 aa  327  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  46.04 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  47.45 
 
 
398 aa  325  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>