More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1295 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  100 
 
 		 402 aa  808    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  98.5 
 
 		 402 aa  796    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  76.56 
 
 		 401 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  72.07 
 
 		 400 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  60.15 
 
 		 403 aa  481  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  59.85 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  55.7 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  54.59 
 
 		 392 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  56.01 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  55.2 
 
 		 1305 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  54.59 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  52.88 
 
 		 411 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  54.52 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  54.87 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  51.02 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  49.37 
 
 		 403 aa  378  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  47.06 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  49.25 
 
 		 405 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  54.1 
 
 		 1230 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  50.26 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  50.25 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  53.06 
 
 		 398 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  52.3 
 
 		 401 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  47.69 
 
 		 402 aa  363  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  52.69 
 
 		 389 aa  363  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  52.79 
 
 		 382 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  50.77 
 
 		 391 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  47.45 
 
 		 396 aa  359  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  54.09 
 
 		 1228 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  47.46 
 
 		 391 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  50 
 
 		 399 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  51.64 
 
 		 402 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  52.44 
 
 		 389 aa  356  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  47.36 
 
 		 400 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  48.89 
 
 		 404 aa  354  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  49.49 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  52.3 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  49.36 
 
 		 404 aa  352  7e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  54.1 
 
 		 1230 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  47.49 
 
 		 405 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  50.9 
 
 		 389 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  51.02 
 
 		 416 aa  342  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  49.75 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  48.2 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  47.24 
 
 		 405 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  51.39 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  51.39 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  46.35 
 
 		 390 aa  335  9e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  47.78 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  47.1 
 
 		 400 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  51.43 
 
 		 385 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  50.25 
 
 		 404 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  46.27 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  48.72 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  50 
 
 		 396 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  50 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  46.46 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  46.72 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  46.72 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  46.46 
 
 		 392 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  46.46 
 
 		 392 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  46.46 
 
 		 392 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  43.58 
 
 		 372 aa  318  9e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  49.11 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  49.62 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  46.27 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  46.27 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  47.21 
 
 		 392 aa  316  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  48.1 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  48.46 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  46.21 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  45.56 
 
 		 372 aa  309  5e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  47.97 
 
 		 413 aa  309  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  46.06 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  41.88 
 
 		 408 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  44.97 
 
 		 397 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  46.75 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  44.86 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  43.24 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  47.77 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  46.17 
 
 		 397 aa  299  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  48.47 
 
 		 399 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  44.03 
 
 		 412 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  43.89 
 
 		 401 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  46.29 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  36.88 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  42.86 
 
 		 396 aa  278  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  42.36 
 
 		 589 aa  276  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  43.15 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  36.36 
 
 		 397 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  37.44 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  45.62 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  38.83 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  36.67 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  37.19 
 
 		 399 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  35.57 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  39.31 
 
 		 404 aa  269  7e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  38.39 
 
 		 412 aa  268  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  42.39 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  44.3 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>