More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0199 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  100 
 
 
408 aa  830    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  67.66 
 
 
405 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  65.35 
 
 
400 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  64.36 
 
 
400 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  52.91 
 
 
404 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  52.12 
 
 
400 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  53.1 
 
 
391 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  50.37 
 
 
407 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  50.38 
 
 
392 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  51 
 
 
396 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  47.89 
 
 
403 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  49.63 
 
 
394 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  48.14 
 
 
402 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  50.25 
 
 
393 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  49.63 
 
 
405 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  46.88 
 
 
396 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  47.89 
 
 
394 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  48.5 
 
 
398 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  47.06 
 
 
402 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  48.42 
 
 
411 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  47.06 
 
 
402 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  48.9 
 
 
390 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  48.14 
 
 
392 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  49.26 
 
 
401 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  49.63 
 
 
405 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  47.37 
 
 
404 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  47.13 
 
 
401 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  46.34 
 
 
1305 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  46.73 
 
 
393 aa  362  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  49.37 
 
 
400 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  48.14 
 
 
398 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  48.51 
 
 
400 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  45.98 
 
 
397 aa  349  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  48.16 
 
 
398 aa  348  8e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  46.65 
 
 
393 aa  346  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  48.59 
 
 
389 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  46.72 
 
 
403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  47.56 
 
 
382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  47.89 
 
 
402 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  42.33 
 
 
372 aa  335  7e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  48.15 
 
 
394 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  48.09 
 
 
396 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  45.23 
 
 
390 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  48.09 
 
 
396 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  42.57 
 
 
401 aa  331  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  44.03 
 
 
391 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  47.73 
 
 
389 aa  328  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  47.03 
 
 
416 aa  328  8e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  45.57 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  45.79 
 
 
1228 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  44.08 
 
 
397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  47.64 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  47.64 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  45.3 
 
 
1230 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  41.15 
 
 
408 aa  325  9e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  45.76 
 
 
392 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  45.39 
 
 
392 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  45.86 
 
 
392 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  45.86 
 
 
392 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  45.61 
 
 
392 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  45.61 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  45.61 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  46.31 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  45.61 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  41.44 
 
 
372 aa  321  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  45.09 
 
 
397 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  46.1 
 
 
389 aa  316  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  44.85 
 
 
1230 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  44.63 
 
 
395 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  42.57 
 
 
401 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  47.45 
 
 
385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  42.68 
 
 
393 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  42.68 
 
 
393 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  42.47 
 
 
392 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  42.79 
 
 
392 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  43.93 
 
 
404 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  44.53 
 
 
371 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  46.09 
 
 
367 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  43.14 
 
 
391 aa  286  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  42.46 
 
 
371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  43.98 
 
 
413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  44.99 
 
 
399 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  40.98 
 
 
412 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  42.86 
 
 
396 aa  280  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  45.45 
 
 
399 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  41.65 
 
 
410 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  40.14 
 
 
399 aa  276  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  38.4 
 
 
394 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  41.4 
 
 
394 aa  274  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  37.89 
 
 
404 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  40.59 
 
 
402 aa  266  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  40.43 
 
 
407 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2309  acetate kinase  37.5 
 
 
396 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  39.61 
 
 
417 aa  263  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  39.95 
 
 
400 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  39.95 
 
 
400 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  40.82 
 
 
394 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  36.83 
 
 
399 aa  260  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  39.85 
 
 
399 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  40.49 
 
 
380 aa  259  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>