More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4871 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  100 
 
 
402 aa  800    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  98.51 
 
 
402 aa  785    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  100 
 
 
402 aa  800    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  60.56 
 
 
394 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  58.72 
 
 
392 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  57.11 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  58.21 
 
 
390 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  55.36 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  54.31 
 
 
400 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  55.13 
 
 
392 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  54.11 
 
 
411 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  52.86 
 
 
393 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  55.05 
 
 
400 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  52.96 
 
 
402 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  55.3 
 
 
1305 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  53.28 
 
 
398 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  53.49 
 
 
394 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  52.88 
 
 
405 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  54.04 
 
 
401 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  53.32 
 
 
400 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  53.18 
 
 
401 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  52.9 
 
 
399 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  53.05 
 
 
400 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  51.9 
 
 
393 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  51.66 
 
 
402 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  51.39 
 
 
402 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  51.66 
 
 
396 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  53.59 
 
 
394 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  52.99 
 
 
390 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  48.59 
 
 
403 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  52.49 
 
 
407 aa  359  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  48.21 
 
 
391 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  54.76 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  53.28 
 
 
398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  51.16 
 
 
391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  53.37 
 
 
1230 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  50.5 
 
 
397 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  53.67 
 
 
392 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  53.42 
 
 
392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  47.64 
 
 
408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  53.42 
 
 
392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  53.42 
 
 
392 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  53.42 
 
 
392 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  53.42 
 
 
392 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  53.16 
 
 
392 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  51.38 
 
 
405 aa  349  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  52.28 
 
 
400 aa  349  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  53.87 
 
 
1230 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  49 
 
 
393 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  48.74 
 
 
405 aa  342  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  52.5 
 
 
1228 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  47.38 
 
 
404 aa  338  7e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  50.52 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  47.79 
 
 
404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  53.45 
 
 
385 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  48.88 
 
 
397 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  51.18 
 
 
389 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  47.75 
 
 
403 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  49.36 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  50 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  48.57 
 
 
396 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  48.31 
 
 
396 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  51.01 
 
 
389 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  47.39 
 
 
391 aa  320  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  48.43 
 
 
371 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  48.07 
 
 
393 aa  315  9e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  48.07 
 
 
393 aa  315  9e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  48.72 
 
 
404 aa  315  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  47.27 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  47.79 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  47.96 
 
 
397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  46.84 
 
 
412 aa  312  5.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  47.76 
 
 
371 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  42.64 
 
 
408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  42.35 
 
 
399 aa  305  7e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  47.45 
 
 
407 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  43.22 
 
 
394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  45.66 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  49.62 
 
 
399 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  44.84 
 
 
402 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  45.77 
 
 
395 aa  299  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  46.9 
 
 
413 aa  295  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  43.96 
 
 
396 aa  295  9e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  45.15 
 
 
397 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  41.98 
 
 
401 aa  293  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  46.25 
 
 
392 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  43.36 
 
 
412 aa  292  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  48.58 
 
 
399 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  46.29 
 
 
392 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  40.77 
 
 
372 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  40.72 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  40.1 
 
 
404 aa  277  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  40.1 
 
 
372 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  42.24 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  38.86 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  50.29 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  41.67 
 
 
593 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  38.56 
 
 
397 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  36.43 
 
 
404 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2195  acetate kinase  44.1 
 
 
358 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000385567  hitchhiker  0.000228017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>