More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0632 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  100 
 
 		 382 aa  769    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  55.36 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  55.3 
 
 		 404 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  56.07 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  52.06 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  50.75 
 
 		 411 aa  375  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  52.79 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  50 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  52.03 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  52.17 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  50.26 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  55.03 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  52.2 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  49.75 
 
 		 405 aa  359  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  49.87 
 
 		 391 aa  358  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  49.47 
 
 		 400 aa  358  8e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  47.52 
 
 		 402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  46.86 
 
 		 403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  50.13 
 
 		 392 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  49.62 
 
 		 394 aa  352  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  51.8 
 
 		 401 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  50.91 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  47.83 
 
 		 408 aa  349  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  50.52 
 
 		 389 aa  348  7e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  49.48 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  52.51 
 
 		 398 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  49.34 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  50.39 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  48.96 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  49.74 
 
 		 405 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  50.39 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  48.21 
 
 		 392 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  51.03 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  53.06 
 
 		 1230 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  49.34 
 
 		 400 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  48.46 
 
 		 393 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  53.59 
 
 		 1230 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  50.53 
 
 		 396 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  50.53 
 
 		 396 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  49.1 
 
 		 1305 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  47.09 
 
 		 394 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  51.02 
 
 		 1228 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  47.12 
 
 		 393 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  47.12 
 
 		 393 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  49.22 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  48.4 
 
 		 389 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  48.05 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  47.36 
 
 		 416 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  48.82 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  47.27 
 
 		 404 aa  315  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  44.79 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  46.29 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  49.59 
 
 		 385 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  46.45 
 
 		 399 aa  312  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  47.14 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  44.53 
 
 		 413 aa  308  6.999999999999999e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  42.6 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  48.7 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  42.89 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  45.74 
 
 		 402 aa  305  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  47.69 
 
 		 410 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  48.05 
 
 		 399 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  48.41 
 
 		 399 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  42.34 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  44.7 
 
 		 392 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  44.7 
 
 		 392 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  44.44 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  45.24 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  44.44 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  44.44 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  44.44 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  40.46 
 
 		 394 aa  299  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  43.59 
 
 		 391 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  45.38 
 
 		 392 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  43.31 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  43.69 
 
 		 412 aa  295  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  47.42 
 
 		 392 aa  289  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  48.84 
 
 		 402 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  48.84 
 
 		 402 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  43.75 
 
 		 371 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  40.31 
 
 		 399 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  43.75 
 
 		 371 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  41.24 
 
 		 412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  39.48 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  40.77 
 
 		 393 aa  282  7.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  47.81 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  38.87 
 
 		 397 aa  279  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  39.13 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  45.03 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  38.87 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  38.87 
 
 		 397 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  43.49 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  38.87 
 
 		 397 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  43.93 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  39.95 
 
 		 401 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  39.14 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  38.62 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  38.62 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  38.62 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  39.14 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>