More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2655 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  100 
 
 
405 aa  811    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  57.5 
 
 
404 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  58.25 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  56.67 
 
 
404 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  56.07 
 
 
382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  56.3 
 
 
391 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  53.88 
 
 
400 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  52.51 
 
 
405 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  52.43 
 
 
393 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  52.26 
 
 
411 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  51.4 
 
 
396 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  53.06 
 
 
390 aa  378  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  54.14 
 
 
400 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  51.65 
 
 
394 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  51.65 
 
 
400 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  51.67 
 
 
398 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  49.63 
 
 
408 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  52.64 
 
 
398 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  52.15 
 
 
407 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  48.48 
 
 
402 aa  368  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  50.51 
 
 
394 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  50.88 
 
 
396 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  49.36 
 
 
392 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  48.85 
 
 
403 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  52.3 
 
 
398 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  50.64 
 
 
392 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  49.87 
 
 
393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  50.26 
 
 
393 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  50.5 
 
 
405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  50.38 
 
 
401 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  50 
 
 
1305 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  50.79 
 
 
389 aa  352  7e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  48.49 
 
 
390 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  47.74 
 
 
402 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  47.49 
 
 
402 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  50.25 
 
 
400 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  50 
 
 
401 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  50.91 
 
 
389 aa  345  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  54.88 
 
 
385 aa  343  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  49.49 
 
 
394 aa  340  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  49.62 
 
 
392 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  48.41 
 
 
400 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  46.37 
 
 
397 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  49.35 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  49.35 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  49.1 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  49.87 
 
 
1230 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  49.1 
 
 
392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  49.1 
 
 
392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  49.1 
 
 
392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  47.67 
 
 
404 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  50.13 
 
 
389 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  42.57 
 
 
408 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  47.73 
 
 
399 aa  333  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  46.82 
 
 
396 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  46.82 
 
 
396 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  48.76 
 
 
402 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  46.82 
 
 
396 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  45.71 
 
 
393 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  45.71 
 
 
393 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  43.5 
 
 
401 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  45.69 
 
 
391 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  43.38 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  43.12 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  49.11 
 
 
1230 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  46.68 
 
 
397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  47.06 
 
 
392 aa  318  9e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  46.91 
 
 
416 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  43.94 
 
 
395 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  47.97 
 
 
1228 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  48.99 
 
 
399 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  49.74 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  48.74 
 
 
402 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  48.74 
 
 
402 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  46.53 
 
 
371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  46.45 
 
 
407 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  46.39 
 
 
371 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  44.17 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  43.75 
 
 
401 aa  305  7e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  45.09 
 
 
403 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  44 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  41.79 
 
 
394 aa  302  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  43.94 
 
 
412 aa  299  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  44.22 
 
 
413 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  40.1 
 
 
398 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  44.05 
 
 
412 aa  293  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  43.59 
 
 
392 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  41.77 
 
 
399 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  38.52 
 
 
404 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  44.03 
 
 
391 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  43.78 
 
 
396 aa  286  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  42.53 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  46.7 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  39.75 
 
 
398 aa  282  9e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  38.87 
 
 
394 aa  281  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  43.72 
 
 
394 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  39.15 
 
 
399 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  38.1 
 
 
399 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  40.98 
 
 
393 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  40 
 
 
399 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>