More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1128 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  78.89 
 
 		 398 aa  642    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  83.75 
 
 		 400 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  100 
 
 		 401 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  62.63 
 
 		 394 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  59.69 
 
 		 394 aa  441  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  56.3 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  57.11 
 
 		 411 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  57.89 
 
 		 396 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  56.82 
 
 		 393 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  56.17 
 
 		 393 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  56.17 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  54.94 
 
 		 392 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  57.36 
 
 		 390 aa  405  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  55.5 
 
 		 1305 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  56.59 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  53.57 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  54.8 
 
 		 393 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  53.96 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  52.64 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  54.66 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  51.53 
 
 		 402 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  51.97 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  49.5 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  52.55 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  54.85 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  52.3 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  54.04 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  51.93 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  53.03 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  54.48 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  49.11 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  51.74 
 
 		 399 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  53.33 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  50.63 
 
 		 405 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  54.29 
 
 		 402 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  51.26 
 
 		 390 aa  363  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  54.29 
 
 		 402 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  46.77 
 
 		 403 aa  360  4e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  53.63 
 
 		 1230 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  50.64 
 
 		 393 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  50.64 
 
 		 393 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  51.39 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  51.88 
 
 		 392 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  50.13 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  52.03 
 
 		 391 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  53.21 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  53.21 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  49 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  51.28 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  52.45 
 
 		 1230 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  48.98 
 
 		 403 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  49.51 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  49.75 
 
 		 395 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  51.16 
 
 		 382 aa  343  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  49.26 
 
 		 407 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  52.42 
 
 		 396 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  49.75 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  48.35 
 
 		 412 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  51.85 
 
 		 1228 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  49.26 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  48.77 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  45.18 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  53.33 
 
 		 385 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  49.38 
 
 		 404 aa  329  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  50 
 
 		 371 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  46.75 
 
 		 402 aa  325  9e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  47.47 
 
 		 391 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  49.49 
 
 		 392 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  49.49 
 
 		 392 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  49.38 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  49.23 
 
 		 392 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  46.68 
 
 		 413 aa  315  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  49.23 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  49.23 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  49.23 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  50.78 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  48.84 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  45.27 
 
 		 412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  42.71 
 
 		 401 aa  312  5.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  46.39 
 
 		 397 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  47.3 
 
 		 392 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  46.29 
 
 		 396 aa  306  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  45.69 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  43.59 
 
 		 393 aa  302  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  40.72 
 
 		 372 aa  302  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  47.95 
 
 		 397 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  39.31 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  40.62 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  45.09 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  42.71 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  45.94 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  40.45 
 
 		 399 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  42.32 
 
 		 394 aa  293  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  47.1 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  39.26 
 
 		 397 aa  290  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  37.71 
 
 		 406 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  38.6 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  37.97 
 
 		 404 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  37.91 
 
 		 399 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  40.4 
 
 		 422 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>