More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4284 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  100 
 
 		 399 aa  788    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  87.53 
 
 		 404 aa  686    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  97.49 
 
 		 399 aa  718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  58.19 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  57.11 
 
 		 393 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  57.11 
 
 		 393 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  57.39 
 
 		 412 aa  401  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  55.53 
 
 		 395 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  53.49 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  48.99 
 
 		 405 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  49.38 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  50.9 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  48.4 
 
 		 398 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  50.64 
 
 		 400 aa  329  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  48.87 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  46.81 
 
 		 404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  49.87 
 
 		 390 aa  325  9e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  50.51 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  50.76 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  50.76 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  50.51 
 
 		 392 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  50.51 
 
 		 392 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  50.51 
 
 		 392 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  50.91 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  47.52 
 
 		 402 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  49.14 
 
 		 401 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  47.77 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  50.12 
 
 		 416 aa  319  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  47.43 
 
 		 397 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  49.14 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  49.12 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  46.46 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  47.12 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  46.84 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  49.1 
 
 		 389 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  46.5 
 
 		 397 aa  316  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  47.37 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  46.95 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  46.84 
 
 		 393 aa  313  4.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  47.75 
 
 		 399 aa  313  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  45.77 
 
 		 400 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  48.05 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  47.63 
 
 		 1305 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  46.04 
 
 		 402 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  46.77 
 
 		 398 aa  308  9e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  48.76 
 
 		 413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  49.12 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  49.47 
 
 		 371 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  49.12 
 
 		 402 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  48.08 
 
 		 401 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  46.87 
 
 		 398 aa  305  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  45.76 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  45.71 
 
 		 393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  47.79 
 
 		 390 aa  303  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  45.95 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  44.99 
 
 		 408 aa  298  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  44.95 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  45.23 
 
 		 405 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  46.25 
 
 		 400 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  48.06 
 
 		 396 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  48.14 
 
 		 371 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  45.15 
 
 		 404 aa  296  6e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  47.8 
 
 		 396 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  41.9 
 
 		 408 aa  295  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  42.49 
 
 		 401 aa  295  8e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  43.07 
 
 		 403 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  45.1 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  44.25 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  46.75 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  45.89 
 
 		 397 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  49.62 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  49.62 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  44.75 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  47.47 
 
 		 392 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  43.8 
 
 		 412 aa  282  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  46 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  43.26 
 
 		 396 aa  276  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  41.62 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  44.39 
 
 		 385 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  42.24 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  40.36 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  46.58 
 
 		 1230 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  46.08 
 
 		 394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  43.92 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  38.29 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  46.35 
 
 		 1228 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  46.23 
 
 		 1230 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  41.75 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0354  acetate kinase  37.96 
 
 		 405 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  35.86 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  35.24 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  37.06 
 
 		 405 aa  263  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  39.29 
 
 		 593 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  41.43 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  42.61 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  42.93 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  38.44 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  34.31 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  35.12 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  34.18 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>