More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3686 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  100 
 
 
393 aa  804    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  69.9 
 
 
392 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  63.12 
 
 
396 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  62.08 
 
 
394 aa  474  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  62.18 
 
 
392 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  57.99 
 
 
398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  57.83 
 
 
411 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  58.06 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  56.31 
 
 
401 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  54.38 
 
 
1305 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  57.07 
 
 
400 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  52.84 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  53.08 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  52.43 
 
 
396 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  54.66 
 
 
398 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  55.09 
 
 
401 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  53.35 
 
 
399 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  50.77 
 
 
403 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  53.09 
 
 
394 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  54.52 
 
 
402 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  51.04 
 
 
402 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  54.52 
 
 
402 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  54.26 
 
 
390 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  54.96 
 
 
393 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  51.94 
 
 
404 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  52.86 
 
 
400 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  54.22 
 
 
1230 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  51.55 
 
 
403 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  52.6 
 
 
402 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  52.31 
 
 
392 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  51.93 
 
 
389 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  51.02 
 
 
394 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  49.75 
 
 
405 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  50.26 
 
 
397 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  46.73 
 
 
408 aa  362  7.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  48.85 
 
 
400 aa  362  9e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  50.13 
 
 
391 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  53.83 
 
 
1230 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  50.26 
 
 
405 aa  360  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  48.6 
 
 
390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  52.86 
 
 
402 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  52.86 
 
 
402 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  48.72 
 
 
407 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  51.19 
 
 
389 aa  349  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  48.61 
 
 
404 aa  345  8e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  52.04 
 
 
1228 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  47.87 
 
 
407 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  46.67 
 
 
391 aa  342  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  52.59 
 
 
389 aa  342  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  49.74 
 
 
393 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  49.74 
 
 
393 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  48.21 
 
 
405 aa  338  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  47.57 
 
 
400 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5754  acetate and butyrate kinase  88.77 
 
 
252 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0438742  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  46.92 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  46 
 
 
412 aa  325  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  48.04 
 
 
396 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  48.04 
 
 
396 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  48.97 
 
 
396 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  48.46 
 
 
382 aa  324  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  50.43 
 
 
385 aa  318  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  45.45 
 
 
410 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  47.24 
 
 
416 aa  315  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  44.67 
 
 
391 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  46.77 
 
 
394 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  45.01 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  45.15 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  43.48 
 
 
397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  44.5 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  43.19 
 
 
393 aa  306  6e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  42.89 
 
 
392 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  42.89 
 
 
392 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  43.51 
 
 
392 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  43 
 
 
392 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  45.71 
 
 
404 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  46.07 
 
 
371 aa  299  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  43.99 
 
 
412 aa  298  9e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  42.64 
 
 
392 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  46.07 
 
 
371 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  42.64 
 
 
392 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  42.64 
 
 
392 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  43.65 
 
 
394 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  41.29 
 
 
398 aa  295  9e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  40.78 
 
 
401 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  41.28 
 
 
372 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  40.26 
 
 
408 aa  292  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  41.27 
 
 
372 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  44.56 
 
 
397 aa  288  9e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  45.71 
 
 
399 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  39.7 
 
 
397 aa  286  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  45.95 
 
 
399 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  40.71 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  41.27 
 
 
397 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  39.59 
 
 
397 aa  281  1e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  39.75 
 
 
398 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  40.91 
 
 
395 aa  276  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  42.32 
 
 
399 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  48.75 
 
 
397 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  40.45 
 
 
408 aa  275  9e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  39.26 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>