More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4427 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  100 
 
 		 393 aa  798    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  100 
 
 		 393 aa  798    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  70.77 
 
 		 412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  69.37 
 
 		 410 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  68.22 
 
 		 395 aa  525  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  66.32 
 
 		 402 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  57.07 
 
 		 404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  57.11 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  57.56 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  49.87 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  50.13 
 
 		 401 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  49.23 
 
 		 392 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  49.88 
 
 		 411 aa  346  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  49.23 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  49.87 
 
 		 389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  49.74 
 
 		 393 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  50.25 
 
 		 399 aa  342  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  48.61 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  47.69 
 
 		 394 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  48.47 
 
 		 400 aa  338  9e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  46.94 
 
 		 393 aa  336  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  47.57 
 
 		 398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  48.36 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  48.08 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  49.49 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  50.13 
 
 		 389 aa  332  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  48.22 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  48.22 
 
 		 396 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  48.97 
 
 		 396 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  45.71 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  46.31 
 
 		 402 aa  322  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  46.67 
 
 		 397 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  48.85 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  49.11 
 
 		 396 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  47.98 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  46.53 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  46.43 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  46.55 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  46.27 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  44.9 
 
 		 392 aa  316  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  45.86 
 
 		 405 aa  316  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  46.48 
 
 		 382 aa  315  8e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  45.04 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  47.8 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  47.07 
 
 		 1305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  45.64 
 
 		 404 aa  309  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  47.26 
 
 		 401 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  47.22 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  47.99 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  47.7 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  48.33 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  47.18 
 
 		 413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  43.96 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  44.1 
 
 		 412 aa  299  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  42.68 
 
 		 408 aa  298  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  40.51 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  45.29 
 
 		 400 aa  296  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  44.25 
 
 		 405 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  44.25 
 
 		 407 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  46.28 
 
 		 371 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  44.53 
 
 		 391 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  40.6 
 
 		 403 aa  292  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  47.59 
 
 		 1230 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  46.28 
 
 		 371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  44.95 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  47.33 
 
 		 1228 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  48.07 
 
 		 402 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  48.07 
 
 		 402 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  44.85 
 
 		 392 aa  285  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  42.71 
 
 		 391 aa  285  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  46.82 
 
 		 1230 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  44.76 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  40.65 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  44.76 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  44.76 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  45.71 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  43.33 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  42.49 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  44.5 
 
 		 392 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  44.5 
 
 		 392 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  44.5 
 
 		 392 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  40.8 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  39.45 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  39.33 
 
 		 408 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  40.89 
 
 		 393 aa  275  9e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  38.05 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  39.45 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  37.19 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  42.78 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  39.04 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  41.15 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  39.79 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  39.09 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  38.94 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  38.58 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  38.83 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  47.04 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  41.98 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  38.32 
 
 		 397 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  39.29 
 
 		 404 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>