More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2692 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  91.92 
 
 
396 aa  686    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  100 
 
 
396 aa  780    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  91.92 
 
 
396 aa  685    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  52.16 
 
 
398 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  52.76 
 
 
389 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  54.59 
 
 
390 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  50.78 
 
 
393 aa  359  6e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  50.9 
 
 
400 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  49.61 
 
 
402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  50.79 
 
 
389 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  53.25 
 
 
394 aa  352  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  51.41 
 
 
396 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  50 
 
 
411 aa  348  9e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  52.08 
 
 
389 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  49.22 
 
 
394 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  51.04 
 
 
398 aa  345  7e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  50.13 
 
 
400 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  52.42 
 
 
401 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  51.56 
 
 
391 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  51.03 
 
 
396 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  49.87 
 
 
403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  46.97 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  51.55 
 
 
395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  51.26 
 
 
398 aa  334  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  49.62 
 
 
405 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  45.85 
 
 
403 aa  333  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  50.51 
 
 
399 aa  333  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  51.89 
 
 
400 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  49.62 
 
 
393 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  49.23 
 
 
393 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  49.23 
 
 
393 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  45.48 
 
 
404 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  47.61 
 
 
405 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  47.56 
 
 
392 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  47.89 
 
 
392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  45.24 
 
 
394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  48.3 
 
 
404 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  50.26 
 
 
402 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  50 
 
 
394 aa  324  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  46.31 
 
 
408 aa  323  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  46.07 
 
 
408 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  49.87 
 
 
382 aa  323  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  50.13 
 
 
390 aa  322  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  49.61 
 
 
400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  48.84 
 
 
402 aa  319  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  47.83 
 
 
407 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  49.09 
 
 
393 aa  316  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  49.24 
 
 
400 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  48.46 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  52.48 
 
 
1230 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  48.79 
 
 
371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  48.98 
 
 
401 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  48.79 
 
 
371 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  47.42 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  50 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  50 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  47.8 
 
 
1305 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  49.23 
 
 
410 aa  308  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  52.48 
 
 
1230 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  48.2 
 
 
402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  49.01 
 
 
385 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  47.14 
 
 
392 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  46.51 
 
 
391 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  47.14 
 
 
392 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  46.88 
 
 
392 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  50.91 
 
 
1228 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  46.88 
 
 
392 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  46.88 
 
 
392 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  47.78 
 
 
412 aa  299  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  46.88 
 
 
392 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  46.44 
 
 
397 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  43.57 
 
 
401 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  45.48 
 
 
416 aa  295  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  48.44 
 
 
392 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  45.88 
 
 
391 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  45.29 
 
 
413 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  47.58 
 
 
392 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  48.28 
 
 
397 aa  291  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  45.03 
 
 
392 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  42.82 
 
 
399 aa  289  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  42.64 
 
 
398 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  42.78 
 
 
397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  46.25 
 
 
404 aa  285  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  43.36 
 
 
407 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  47.14 
 
 
392 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  43.57 
 
 
401 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  47.49 
 
 
399 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  46.89 
 
 
399 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  41.43 
 
 
405 aa  279  6e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  40.82 
 
 
406 aa  278  8e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  42.05 
 
 
396 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  41.49 
 
 
397 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  41.88 
 
 
393 aa  277  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  41.56 
 
 
398 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  38.36 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  41.3 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  40.41 
 
 
406 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  38.36 
 
 
401 aa  272  6e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  40.98 
 
 
397 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  42.6 
 
 
412 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>