More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5046 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  100 
 
 		 398 aa  803    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  78.89 
 
 		 401 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  74.62 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  60.86 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  60.2 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  58.9 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  58.1 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  57.58 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  56.68 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  56.93 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  58.06 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  55.73 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  54.73 
 
 		 1305 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  54.43 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  52.94 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  54.71 
 
 		 390 aa  391  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  52.56 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  52.9 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  54.92 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  53.09 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  52.64 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  52.43 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  48.84 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  51.24 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  53.45 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  52.63 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  51.28 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  50.76 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  52.78 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  52.3 
 
 		 405 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  51.28 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  53.06 
 
 		 402 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  52.19 
 
 		 396 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  52.19 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  50.25 
 
 		 391 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  53.32 
 
 		 402 aa  363  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  52.53 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  52.04 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  48.14 
 
 		 408 aa  360  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  51.27 
 
 		 403 aa  358  8e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  54.31 
 
 		 1230 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  52.17 
 
 		 382 aa  358  8e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  53.88 
 
 		 1228 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  53.28 
 
 		 402 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  53.28 
 
 		 402 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  52.08 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  52.74 
 
 		 1230 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  50.38 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  50.77 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  50.75 
 
 		 389 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  51.64 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  50.63 
 
 		 392 aa  345  7e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  49.87 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  47.57 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  47.57 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  50.26 
 
 		 385 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  47.28 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  47.88 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  49.63 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  45.94 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  47.56 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  47.98 
 
 		 391 aa  323  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  44.61 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  49.61 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  45.98 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  48.33 
 
 		 392 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  47.55 
 
 		 416 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  46.55 
 
 		 405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  48.33 
 
 		 392 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  48.4 
 
 		 399 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  47.81 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  47.68 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  45.61 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  48.25 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  47.81 
 
 		 392 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  47.81 
 
 		 392 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  47.81 
 
 		 392 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  42.49 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  47.14 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  42.05 
 
 		 372 aa  305  7e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  41.31 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  45.78 
 
 		 394 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  46.77 
 
 		 371 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  44.13 
 
 		 412 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  39.3 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  43.33 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  41.97 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  47.33 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  45.73 
 
 		 396 aa  296  5e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  38.56 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  42.5 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  38.48 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  41.31 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  39.49 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  44.97 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  37.97 
 
 		 401 aa  282  8.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  38.75 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  37.75 
 
 		 406 aa  280  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  41.77 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  38.12 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>