More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0754 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  100 
 
 		 410 aa  815    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  78.48 
 
 		 412 aa  629  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  71.97 
 
 		 402 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  69.37 
 
 		 393 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  69.37 
 
 		 393 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  67.35 
 
 		 395 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  59.09 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  58.19 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  58.49 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  48.28 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  49.38 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  48.51 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  47.28 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  49.02 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  49.5 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  47.78 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  47.5 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  45.86 
 
 		 393 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  48.28 
 
 		 399 aa  323  5e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  47.13 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  46.7 
 
 		 402 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  48.61 
 
 		 396 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  45.45 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  46.21 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  46.41 
 
 		 407 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  44.23 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  47.1 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  46.19 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  48.58 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  45.25 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  48.84 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  48.32 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  47.56 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  46.37 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  44.47 
 
 		 403 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  49.87 
 
 		 400 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  48.84 
 
 		 396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  47.26 
 
 		 1305 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  46.75 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  47.28 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  48.48 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  44 
 
 		 405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  47.13 
 
 		 405 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  47.4 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  47.44 
 
 		 382 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  47.92 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  48.18 
 
 		 371 aa  298  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  46.53 
 
 		 392 aa  296  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  46.91 
 
 		 401 aa  296  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  43.43 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  46.56 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  46.56 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  46.56 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  45.91 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  46.1 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  46.31 
 
 		 392 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  46.31 
 
 		 392 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  46.31 
 
 		 392 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  45.15 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  41.83 
 
 		 399 aa  292  9e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  45.45 
 
 		 390 aa  292  9e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  46.73 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  44.17 
 
 		 407 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  45.52 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  45.52 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  43.81 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  44.33 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  47.79 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  47.79 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  42.48 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  43.07 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  43.32 
 
 		 412 aa  279  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  41.65 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  47.26 
 
 		 1230 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  43.83 
 
 		 394 aa  276  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  43.8 
 
 		 400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  48.58 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  41.58 
 
 		 396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  47.27 
 
 		 397 aa  269  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  37.88 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  47.26 
 
 		 1230 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  40.82 
 
 		 393 aa  266  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  45.57 
 
 		 1228 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  43.65 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  42.82 
 
 		 397 aa  262  8.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  36.05 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  36.14 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  37.13 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  37.62 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  40.45 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  39.65 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  37.78 
 
 		 408 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  39.35 
 
 		 405 aa  255  9e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  35.16 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0354  acetate kinase  38.46 
 
 		 405 aa  254  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  37.16 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  39.7 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  35.91 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  36.57 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  39.07 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>