More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1621 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  100 
 
 
393 aa  795    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  61.94 
 
 
399 aa  485  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  58.42 
 
 
397 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  54.97 
 
 
396 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  48.04 
 
 
412 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  44.92 
 
 
394 aa  345  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  46.19 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  44.56 
 
 
397 aa  311  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  44.16 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  44.7 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  43.19 
 
 
393 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  45.41 
 
 
390 aa  305  9.000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  43.08 
 
 
393 aa  302  7.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  45.64 
 
 
398 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  43.59 
 
 
401 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  43.22 
 
 
403 aa  298  9e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  43.33 
 
 
398 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  43.91 
 
 
394 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  43.78 
 
 
394 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  41.93 
 
 
389 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  38.72 
 
 
398 aa  291  9e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  42.71 
 
 
398 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  43.78 
 
 
392 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  42.93 
 
 
404 aa  289  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  42.08 
 
 
390 aa  289  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  38.17 
 
 
398 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  43.32 
 
 
399 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  37.56 
 
 
399 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  42.09 
 
 
411 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  42.71 
 
 
400 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  41.01 
 
 
404 aa  286  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  42.16 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  40.2 
 
 
406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  42.08 
 
 
400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  34.25 
 
 
404 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  42.42 
 
 
392 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5272  acetate kinase  41.51 
 
 
386 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1346  acetate kinase  41.51 
 
 
388 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429911  normal  0.010894 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  42.38 
 
 
391 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  36.34 
 
 
394 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  41.09 
 
 
400 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  41.67 
 
 
393 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  40.15 
 
 
396 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  41.41 
 
 
402 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  41.65 
 
 
389 aa  280  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  38.97 
 
 
405 aa  279  6e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  38.99 
 
 
403 aa  278  8e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  38.99 
 
 
403 aa  278  8e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  37.82 
 
 
397 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  40.98 
 
 
405 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  39.03 
 
 
396 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  41.56 
 
 
389 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  39.79 
 
 
391 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  43.22 
 
 
405 aa  276  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  38.62 
 
 
397 aa  275  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  40.89 
 
 
393 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  40.89 
 
 
393 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  40.35 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  40 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  38.36 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  41.32 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  38.87 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  38.11 
 
 
397 aa  273  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  41.35 
 
 
1305 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  37.24 
 
 
401 aa  273  5.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  38.07 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  38.62 
 
 
398 aa  272  6e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  42.08 
 
 
396 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  38.07 
 
 
397 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  42.08 
 
 
396 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  40.4 
 
 
382 aa  272  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  37.6 
 
 
399 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  38.27 
 
 
406 aa  270  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  37.56 
 
 
397 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  37.76 
 
 
397 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  37.18 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  37.31 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  37.31 
 
 
397 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  37.31 
 
 
397 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  37.31 
 
 
397 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  38.38 
 
 
772 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  37.31 
 
 
397 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  37.31 
 
 
397 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  39.16 
 
 
408 aa  269  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  41.82 
 
 
396 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  41.01 
 
 
407 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  37.5 
 
 
408 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  38.05 
 
 
404 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  38.05 
 
 
404 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  39.45 
 
 
397 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  37.34 
 
 
401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  38.05 
 
 
404 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  38.05 
 
 
404 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  38.05 
 
 
404 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  40.25 
 
 
589 aa  266  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  40.82 
 
 
410 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  40.2 
 
 
401 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  39.55 
 
 
402 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  39.13 
 
 
402 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  36.15 
 
 
398 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>