More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2216 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  100 
 
 
372 aa  771    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  95.16 
 
 
372 aa  733    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  49.01 
 
 
367 aa  358  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  41.44 
 
 
408 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  44.05 
 
 
396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  42.68 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  43.38 
 
 
405 aa  322  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  43.43 
 
 
403 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  43.83 
 
 
402 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  42.82 
 
 
402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  45.56 
 
 
402 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  42.67 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  39.95 
 
 
394 aa  312  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  43.18 
 
 
401 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  42.39 
 
 
391 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  39.95 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  42.61 
 
 
407 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  39.85 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  42.46 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  41.97 
 
 
398 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  41.27 
 
 
405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  43.54 
 
 
405 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  41.24 
 
 
390 aa  302  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  41.82 
 
 
382 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  40.62 
 
 
401 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  42.13 
 
 
400 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  39.28 
 
 
397 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  41.56 
 
 
404 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  41.37 
 
 
399 aa  296  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  41.27 
 
 
393 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  38.5 
 
 
393 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  39.33 
 
 
392 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  37.92 
 
 
394 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  39.18 
 
 
396 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  40.62 
 
 
400 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  38.96 
 
 
390 aa  286  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  38.83 
 
 
404 aa  285  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  42.32 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  40.66 
 
 
389 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  40.15 
 
 
1305 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  40 
 
 
391 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  40.36 
 
 
392 aa  279  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  41.69 
 
 
394 aa  276  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  40.41 
 
 
403 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  39.19 
 
 
402 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  38.82 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  39.8 
 
 
398 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  41.04 
 
 
416 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  39.1 
 
 
404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  39.63 
 
 
389 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  42.81 
 
 
385 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  39.5 
 
 
412 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  42.27 
 
 
393 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  42.27 
 
 
393 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  37.12 
 
 
392 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  36.87 
 
 
392 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  36.87 
 
 
392 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  36.87 
 
 
392 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  36.87 
 
 
392 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  36.87 
 
 
392 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  40.1 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  40.1 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  40.63 
 
 
389 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  38.01 
 
 
397 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  36.02 
 
 
392 aa  259  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  40.59 
 
 
391 aa  258  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  39.7 
 
 
410 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  41.23 
 
 
1230 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  41.23 
 
 
1228 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  38.83 
 
 
395 aa  256  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  36.36 
 
 
398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  36.95 
 
 
401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  41.02 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  39.44 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  41.23 
 
 
1230 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  38.07 
 
 
398 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  34.79 
 
 
408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  36.93 
 
 
396 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  40 
 
 
397 aa  252  6e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  38.75 
 
 
399 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  41.67 
 
 
399 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  37.16 
 
 
397 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  37.97 
 
 
397 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  41.26 
 
 
593 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  39.71 
 
 
396 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  39.71 
 
 
396 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  37.56 
 
 
394 aa  248  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  37.76 
 
 
417 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  37.24 
 
 
392 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  37.87 
 
 
401 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  39.19 
 
 
401 aa  246  6.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  39.36 
 
 
404 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  37.44 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  37.44 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  35.22 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  38.23 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  36.27 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  35.8 
 
 
411 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  38.86 
 
 
397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  35.11 
 
 
397 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>