More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1810 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  100 
 
 
394 aa  800    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  45.18 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  46.19 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  45.86 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  47 
 
 
400 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  47.31 
 
 
393 aa  312  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  47.04 
 
 
393 aa  312  7.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  48.88 
 
 
396 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  46.77 
 
 
393 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  46.02 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  44.47 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  46.25 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1346  acetate kinase  45.57 
 
 
388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429911  normal  0.010894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  45.64 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  47.3 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  45.78 
 
 
398 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5272  acetate kinase  44.47 
 
 
386 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  45.66 
 
 
401 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  45.57 
 
 
402 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  43.4 
 
 
412 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  45.45 
 
 
390 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  43.88 
 
 
397 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  41.56 
 
 
405 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  45.84 
 
 
399 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  44 
 
 
404 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  40.3 
 
 
397 aa  289  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  45.9 
 
 
394 aa  288  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  44.09 
 
 
411 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  45.66 
 
 
402 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  45.66 
 
 
402 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  40.36 
 
 
398 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  40.1 
 
 
398 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  39.55 
 
 
397 aa  285  7e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  43.91 
 
 
392 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  40.64 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  45.5 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  43.8 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  38 
 
 
398 aa  281  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  40.55 
 
 
397 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  43.72 
 
 
405 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4498  acetate kinase  46.38 
 
 
356 aa  279  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  39.65 
 
 
399 aa  279  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  38.89 
 
 
398 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  40.66 
 
 
397 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  43.47 
 
 
1305 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  42.32 
 
 
402 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  44.91 
 
 
389 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  43.83 
 
 
410 aa  276  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  38.81 
 
 
398 aa  276  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  42.17 
 
 
391 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  39.01 
 
 
408 aa  275  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  38.94 
 
 
397 aa  275  9e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  39.21 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  37.78 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  43.26 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  38.46 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  43 
 
 
416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  39.1 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  41.4 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  39.6 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  41.77 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  45.41 
 
 
1230 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  39.39 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  38.4 
 
 
404 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  42.78 
 
 
393 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  42.78 
 
 
393 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  39 
 
 
397 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  39.7 
 
 
401 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  38.5 
 
 
406 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  39.5 
 
 
403 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  39.8 
 
 
397 aa  272  1e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  39.5 
 
 
403 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  39 
 
 
397 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  42.5 
 
 
422 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  42.17 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2309  acetate kinase  40.31 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  40.91 
 
 
402 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  39.69 
 
 
396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  39.6 
 
 
399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  40.3 
 
 
402 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  38.6 
 
 
397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  38.75 
 
 
397 aa  268  8e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  38.35 
 
 
397 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  38.35 
 
 
397 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  38.35 
 
 
397 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  38.35 
 
 
397 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  38.35 
 
 
397 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  38.35 
 
 
397 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  42.26 
 
 
389 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  43.18 
 
 
400 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  42 
 
 
401 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  42.82 
 
 
401 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  38.69 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  46.06 
 
 
1230 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  43.91 
 
 
389 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  39.65 
 
 
401 aa  266  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  42.44 
 
 
371 aa  265  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  37.88 
 
 
395 aa  266  7e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  39.14 
 
 
404 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  39.85 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>