More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1346 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1346  acetate kinase  100 
 
 
388 aa  778    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429911  normal  0.010894 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5272  acetate kinase  89.12 
 
 
386 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  45.57 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  41.12 
 
 
399 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4498  acetate kinase  44.47 
 
 
356 aa  282  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  41.51 
 
 
393 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  42.61 
 
 
402 aa  279  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  43.18 
 
 
398 aa  278  9e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  42.16 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  43.41 
 
 
404 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  43.28 
 
 
403 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  39.75 
 
 
399 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  42.57 
 
 
399 aa  266  5.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  41.4 
 
 
397 aa  264  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  37.91 
 
 
399 aa  259  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  41.33 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  37.78 
 
 
397 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  38.79 
 
 
396 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  39.8 
 
 
394 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  40.36 
 
 
393 aa  256  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  37.63 
 
 
397 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  40.73 
 
 
396 aa  256  5e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  43.26 
 
 
394 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  36.84 
 
 
398 aa  255  7e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  36.18 
 
 
397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  40.59 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  42.01 
 
 
404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  42.01 
 
 
404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  42.01 
 
 
404 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  42.01 
 
 
404 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  40.4 
 
 
396 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  37.09 
 
 
397 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  42.01 
 
 
404 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  42.2 
 
 
394 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  41.23 
 
 
411 aa  252  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  38.82 
 
 
397 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  41.69 
 
 
402 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  39.32 
 
 
593 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  38.13 
 
 
400 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  38.13 
 
 
400 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  41.62 
 
 
391 aa  249  5e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  38.54 
 
 
396 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  41.23 
 
 
398 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  39.69 
 
 
382 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  40.52 
 
 
390 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  40.1 
 
 
422 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  40.43 
 
 
372 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  37.34 
 
 
398 aa  247  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  40.66 
 
 
392 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  41.98 
 
 
390 aa  245  8e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  39.1 
 
 
583 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  37.31 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  40.56 
 
 
392 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  37.34 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  38.92 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  44.13 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  38.33 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  36.78 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  35.86 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  36.52 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  41.51 
 
 
380 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  40.93 
 
 
400 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  40.81 
 
 
391 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  35.91 
 
 
406 aa  242  7e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  40.76 
 
 
401 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  39.04 
 
 
398 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  39.46 
 
 
417 aa  242  9e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  36.66 
 
 
406 aa  241  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  35.03 
 
 
404 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  41.69 
 
 
402 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  41.69 
 
 
402 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  37.38 
 
 
404 aa  240  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  36.54 
 
 
405 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  42.56 
 
 
400 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  35.22 
 
 
404 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  35.22 
 
 
404 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  36.32 
 
 
403 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  40.62 
 
 
394 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  35.26 
 
 
397 aa  238  2e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  39.9 
 
 
378 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  40.31 
 
 
404 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  36.32 
 
 
403 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  40.46 
 
 
589 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  37.53 
 
 
398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  37.28 
 
 
397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  39.04 
 
 
421 aa  236  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  41.9 
 
 
398 aa  235  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  35.18 
 
 
397 aa  236  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  33.83 
 
 
401 aa  235  9e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  38.04 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  39.1 
 
 
372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2207  acetate kinase  36.32 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  41.27 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  42.55 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  37.02 
 
 
421 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  35.66 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  37.29 
 
 
417 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  36.84 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  36.78 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  40.78 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>