More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4498 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4498  acetate kinase  100 
 
 		 356 aa  711    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5272  acetate kinase  45 
 
 		 386 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1346  acetate kinase  45.28 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429911  normal  0.010894 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  46.96 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  40.87 
 
 		 396 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  41.06 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  42.54 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  41.26 
 
 		 393 aa  252  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  42.97 
 
 		 583 aa  250  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2674  acetate kinase  43.73 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  40.1 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  42.69 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  38.19 
 
 		 396 aa  235  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  42.58 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  34.66 
 
 		 397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  38.68 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  41.19 
 
 		 399 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  41.19 
 
 		 399 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  41.19 
 
 		 399 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  41.19 
 
 		 399 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  38.75 
 
 		 593 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  39.14 
 
 		 412 aa  232  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  39.44 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  41.62 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  42.73 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  40.97 
 
 		 400 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  37.76 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  42.49 
 
 		 401 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  39.55 
 
 		 404 aa  229  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  38.14 
 
 		 396 aa  229  8e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  37.5 
 
 		 397 aa  228  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  40.22 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  37.11 
 
 		 396 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  37.39 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  35.34 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  40.38 
 
 		 399 aa  226  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  37.22 
 
 		 404 aa  225  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  39.14 
 
 		 403 aa  226  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  36.48 
 
 		 394 aa  225  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  41.31 
 
 		 405 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  34.93 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  37.81 
 
 		 396 aa  224  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  36.44 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  40.38 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  41.41 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  40.38 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  40.38 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  36.75 
 
 		 396 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  35.39 
 
 		 402 aa  223  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  41.34 
 
 		 413 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  41.51 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  36.62 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  34.34 
 
 		 397 aa  223  6e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  38.11 
 
 		 408 aa  222  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  34.09 
 
 		 398 aa  222  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  35.88 
 
 		 398 aa  222  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  40 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  39.43 
 
 		 589 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  38.21 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  48.91 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  34.26 
 
 		 394 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  38.73 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  37.5 
 
 		 392 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  38.36 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  42.05 
 
 		 416 aa  219  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  38.74 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  39.18 
 
 		 398 aa  219  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  36.52 
 
 		 397 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  37.96 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  36.83 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  38.73 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  35.61 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  39.57 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  39.5 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  39.44 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  38.73 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  44.78 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  37.8 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  38.38 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  39.94 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  37.91 
 
 		 391 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  37.67 
 
 		 372 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2195  acetate kinase  43.34 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000385567  hitchhiker  0.000228017 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  33.15 
 
 		 406 aa  216  4e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  42.94 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  42.17 
 
 		 398 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  38.21 
 
 		 371 aa  215  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  34.09 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  40.22 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  38.81 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2207  acetate kinase  38.99 
 
 		 408 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  34.24 
 
 		 397 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1919  acetate kinase  43.97 
 
 		 361 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0346  acetate kinase  37.89 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00657885  hitchhiker  0.00000356853 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0217  acetate kinase  38.86 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  43.49 
 
 		 401 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  36.41 
 
 		 393 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  34.01 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  40.17 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  42.61 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>